Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXH7

Sgo1, Shugoshin 1, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo1Q9CXH7 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Sgo1Q9CXH7 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Sgo1Q9CXH7 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Sgo1Q9CXH7 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Sgo1Q9CXH7 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Sgo1Q9CXH7 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Sgo1Q9CXH7 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Sgo1Q9CXH7 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
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Sgo1Q9CXH7 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Sgo1Q9CXH7 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Sgo1Q9CXH7 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Sgo1Q9CXH7 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Sgo1Q9CXH7 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Sgo1Q9CXH7 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Sgo1Q9CXH7 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Sgo1Q9CXH7 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Sgo1Q9CXH7 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Sgo1Q9CXH7 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Sgo1Q9CXH7 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Sgo1Q9CXH7 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Sgo1Q9CXH7 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Sgo1Q9CXH7 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Sgo1Q9CXH7 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Sgo1Q9CXH7 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Sgo1Q9CXH7 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Sgo1Q9CXH7 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Sgo1Q9CXH7 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Sgo1Q9CXH7 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Sgo1Q9CXH7 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Sgo1Q9CXH7 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Sgo1Q9CXH7 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Sgo1Q9CXH7 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Sgo1Q9CXH7 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Sgo1Q9CXH7 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Sgo1Q9CXH7 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Sgo1Q9CXH7 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Sgo1Q9CXH7 Cdh20-201ENSMUST00000062528 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Sgo1Q9CXH7 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Sgo1Q9CXH7 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Sgo1Q9CXH7 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Sgo1Q9CXH7 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Sgo1Q9CXH7 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
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Sgo1Q9CXH7 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
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Sgo1Q9CXH7 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
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Sgo1Q9CXH7 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
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Sgo1Q9CXH7 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Sgo1Q9CXH7 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
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Sgo1Q9CXH7 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
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Sgo1Q9CXH7 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
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Sgo1Q9CXH7 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Sgo1Q9CXH7 Alx1-203ENSMUST00000167156 2689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Sgo1Q9CXH7 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Sgo1Q9CXH7 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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Sgo1Q9CXH7 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sgo1Q9CXH7 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sgo1Q9CXH7 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sgo1Q9CXH7 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sgo1Q9CXH7 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sgo1Q9CXH7 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Sgo1Q9CXH7 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sgo1Q9CXH7 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
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