Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE6

Xrcc3, DNA repair protein XRCC3, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc3Q9CXE6 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Xrcc3Q9CXE6 Adgrl3-201ENSMUST00000036068 6203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Xrcc3Q9CXE6 Adgrl3-202ENSMUST00000072521 6203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Xrcc3Q9CXE6 Rassf4-201ENSMUST00000035842 6460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Xrcc3Q9CXE6 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Xrcc3Q9CXE6 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Xrcc3Q9CXE6 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Xrcc3Q9CXE6 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Xrcc3Q9CXE6 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Xrcc3Q9CXE6 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Xrcc3Q9CXE6 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Xrcc3Q9CXE6 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Xrcc3Q9CXE6 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Xrcc3Q9CXE6 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Xrcc3Q9CXE6 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Xrcc3Q9CXE6 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Xrcc3Q9CXE6 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Xrcc3Q9CXE6 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Xrcc3Q9CXE6 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Xrcc3Q9CXE6 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Xrcc3Q9CXE6 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Xrcc3Q9CXE6 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Xrcc3Q9CXE6 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Xrcc3Q9CXE6 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Xrcc3Q9CXE6 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Xrcc3Q9CXE6 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Xrcc3Q9CXE6 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Xrcc3Q9CXE6 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Xrcc3Q9CXE6 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Xrcc3Q9CXE6 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Xrcc3Q9CXE6 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Xrcc3Q9CXE6 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Xrcc3Q9CXE6 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Xrcc3Q9CXE6 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Xrcc3Q9CXE6 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Xrcc3Q9CXE6 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Xrcc3Q9CXE6 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Xrcc3Q9CXE6 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Xrcc3Q9CXE6 Aldh3a1-202ENSMUST00000108716 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Xrcc3Q9CXE6 Olfr1490-202ENSMUST00000213900 5165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Xrcc3Q9CXE6 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Xrcc3Q9CXE6 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Xrcc3Q9CXE6 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Xrcc3Q9CXE6 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Xrcc3Q9CXE6 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Xrcc3Q9CXE6 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Xrcc3Q9CXE6 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Xrcc3Q9CXE6 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Xrcc3Q9CXE6 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Xrcc3Q9CXE6 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Xrcc3Q9CXE6 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Xrcc3Q9CXE6 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Xrcc3Q9CXE6 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Xrcc3Q9CXE6 Gpr161-201ENSMUST00000111450 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Xrcc3Q9CXE6 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Xrcc3Q9CXE6 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Xrcc3Q9CXE6 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Xrcc3Q9CXE6 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Xrcc3Q9CXE6 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Xrcc3Q9CXE6 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Xrcc3Q9CXE6 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Xrcc3Q9CXE6 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Xrcc3Q9CXE6 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Xrcc3Q9CXE6 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Xrcc3Q9CXE6 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Xrcc3Q9CXE6 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Xrcc3Q9CXE6 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Xrcc3Q9CXE6 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Xrcc3Q9CXE6 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Xrcc3Q9CXE6 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Xrcc3Q9CXE6 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Xrcc3Q9CXE6 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Xrcc3Q9CXE6 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Xrcc3Q9CXE6 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Xrcc3Q9CXE6 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Xrcc3Q9CXE6 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Xrcc3Q9CXE6 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Xrcc3Q9CXE6 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Xrcc3Q9CXE6 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Xrcc3Q9CXE6 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Xrcc3Q9CXE6 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Xrcc3Q9CXE6 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Xrcc3Q9CXE6 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Xrcc3Q9CXE6 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Xrcc3Q9CXE6 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Xrcc3Q9CXE6 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Xrcc3Q9CXE6 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Xrcc3Q9CXE6 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Xrcc3Q9CXE6 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Xrcc3Q9CXE6 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Xrcc3Q9CXE6 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Xrcc3Q9CXE6 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Xrcc3Q9CXE6 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Xrcc3Q9CXE6 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Xrcc3Q9CXE6 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Xrcc3Q9CXE6 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Xrcc3Q9CXE6 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Xrcc3Q9CXE6 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Xrcc3Q9CXE6 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Xrcc3Q9CXE6 Bmp3-203ENSMUST00000200388 6609 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms