Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWW6

Pin4, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase NIMA-interacting 4, mousemouse

Predictions only

Length 131 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pin4Q9CWW6 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pin4Q9CWW6 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pin4Q9CWW6 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pin4Q9CWW6 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pin4Q9CWW6 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pin4Q9CWW6 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pin4Q9CWW6 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pin4Q9CWW6 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pin4Q9CWW6 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Pin4Q9CWW6 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Pin4Q9CWW6 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pin4Q9CWW6 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pin4Q9CWW6 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Pin4Q9CWW6 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pin4Q9CWW6 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pin4Q9CWW6 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pin4Q9CWW6 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pin4Q9CWW6 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pin4Q9CWW6 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pin4Q9CWW6 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pin4Q9CWW6 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pin4Q9CWW6 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pin4Q9CWW6 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pin4Q9CWW6 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pin4Q9CWW6 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pin4Q9CWW6 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pin4Q9CWW6 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pin4Q9CWW6 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pin4Q9CWW6 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pin4Q9CWW6 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pin4Q9CWW6 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pin4Q9CWW6 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pin4Q9CWW6 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Pin4Q9CWW6 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Pin4Q9CWW6 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Pin4Q9CWW6 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Pin4Q9CWW6 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Pin4Q9CWW6 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Pin4Q9CWW6 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Pin4Q9CWW6 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Pin4Q9CWW6 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Pin4Q9CWW6 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pin4Q9CWW6 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pin4Q9CWW6 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pin4Q9CWW6 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pin4Q9CWW6 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pin4Q9CWW6 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pin4Q9CWW6 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Pin4Q9CWW6 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pin4Q9CWW6 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Pin4Q9CWW6 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pin4Q9CWW6 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pin4Q9CWW6 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pin4Q9CWW6 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pin4Q9CWW6 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pin4Q9CWW6 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pin4Q9CWW6 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pin4Q9CWW6 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pin4Q9CWW6 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Pin4Q9CWW6 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pin4Q9CWW6 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pin4Q9CWW6 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pin4Q9CWW6 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Pin4Q9CWW6 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pin4Q9CWW6 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pin4Q9CWW6 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pin4Q9CWW6 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
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Pin4Q9CWW6 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pin4Q9CWW6 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Pin4Q9CWW6 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pin4Q9CWW6 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
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Pin4Q9CWW6 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Pin4Q9CWW6 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Pin4Q9CWW6 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Pin4Q9CWW6 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Pin4Q9CWW6 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Pin4Q9CWW6 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pin4Q9CWW6 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Pin4Q9CWW6 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Pin4Q9CWW6 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Pin4Q9CWW6 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pin4Q9CWW6 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Pin4Q9CWW6 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pin4Q9CWW6 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pin4Q9CWW6 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Pin4Q9CWW6 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Pin4Q9CWW6 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pin4Q9CWW6 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pin4Q9CWW6 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pin4Q9CWW6 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pin4Q9CWW6 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pin4Q9CWW6 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pin4Q9CWW6 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pin4Q9CWW6 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pin4Q9CWW6 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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