Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWM4

Pfdn1, Prefoldin subunit 1, mousemouse

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Length 122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn1Q9CWM4 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pfdn1Q9CWM4 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pfdn1Q9CWM4 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Pfdn1Q9CWM4 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pfdn1Q9CWM4 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pfdn1Q9CWM4 Aen-203ENSMUST00000107425 4956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pfdn1Q9CWM4 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pfdn1Q9CWM4 Cacna1f-201ENSMUST00000115725 6028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pfdn1Q9CWM4 Arhgef2-231ENSMUST00000177498 3966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pfdn1Q9CWM4 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pfdn1Q9CWM4 Stc2-201ENSMUST00000020546 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pfdn1Q9CWM4 Inpp4a-203ENSMUST00000114933 3004 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pfdn1Q9CWM4 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pfdn1Q9CWM4 Cox17-202ENSMUST00000120495 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pfdn1Q9CWM4 D030055H07Rik-202ENSMUST00000150953 4325 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pfdn1Q9CWM4 Tcp11l2-201ENSMUST00000020223 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pfdn1Q9CWM4 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pfdn1Q9CWM4 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pfdn1Q9CWM4 Gm43375-201ENSMUST00000196705 2480 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Pfdn1Q9CWM4 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pfdn1Q9CWM4 Itga11-201ENSMUST00000034774 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pfdn1Q9CWM4 Mageb4-202ENSMUST00000113969 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pfdn1Q9CWM4 Mageb4-201ENSMUST00000096378 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pfdn1Q9CWM4 Rasgrp4-210ENSMUST00000203070 3008 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pfdn1Q9CWM4 Gm19165-201ENSMUST00000204453 1982 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Pfdn1Q9CWM4 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pfdn1Q9CWM4 Sord-201ENSMUST00000110551 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pfdn1Q9CWM4 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pfdn1Q9CWM4 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pfdn1Q9CWM4 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pfdn1Q9CWM4 Pum1-201ENSMUST00000030315 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pfdn1Q9CWM4 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pfdn1Q9CWM4 Zfp617-201ENSMUST00000119003 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pfdn1Q9CWM4 Pde1c-201ENSMUST00000044505 3907 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pfdn1Q9CWM4 Gria1-201ENSMUST00000036315 5546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pfdn1Q9CWM4 Dscaml1-201ENSMUST00000034592 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pfdn1Q9CWM4 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pfdn1Q9CWM4 Cc2d1a-201ENSMUST00000040383 3471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pfdn1Q9CWM4 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pfdn1Q9CWM4 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pfdn1Q9CWM4 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
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Pfdn1Q9CWM4 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
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Pfdn1Q9CWM4 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
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Pfdn1Q9CWM4 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pfdn1Q9CWM4 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
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Pfdn1Q9CWM4 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pfdn1Q9CWM4 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pfdn1Q9CWM4 Tesk2-201ENSMUST00000045542 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
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Pfdn1Q9CWM4 Spen-202ENSMUST00000105786 12299 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pfdn1Q9CWM4 Sod3-201ENSMUST00000101208 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pfdn1Q9CWM4 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pfdn1Q9CWM4 Loxl3-201ENSMUST00000000707 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pfdn1Q9CWM4 Flna-201ENSMUST00000033699 8312 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pfdn1Q9CWM4 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pfdn1Q9CWM4 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
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Pfdn1Q9CWM4 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pfdn1Q9CWM4 Gripap1-203ENSMUST00000115675 3015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pfdn1Q9CWM4 Tie1-203ENSMUST00000184261 4234 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pfdn1Q9CWM4 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pfdn1Q9CWM4 Ube3a-203ENSMUST00000200758 9856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pfdn1Q9CWM4 Golga2-203ENSMUST00000113377 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pfdn1Q9CWM4 Nhsl1-202ENSMUST00000100054 6795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pfdn1Q9CWM4 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pfdn1Q9CWM4 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pfdn1Q9CWM4 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
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Pfdn1Q9CWM4 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pfdn1Q9CWM4 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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Pfdn1Q9CWM4 Gm18165-201ENSMUST00000217426 928 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
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