Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rprd1bQ9CSU0 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rprd1bQ9CSU0 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rprd1bQ9CSU0 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rprd1bQ9CSU0 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Rprd1bQ9CSU0 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rprd1bQ9CSU0 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rprd1bQ9CSU0 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rprd1bQ9CSU0 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rprd1bQ9CSU0 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rprd1bQ9CSU0 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rprd1bQ9CSU0 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rprd1bQ9CSU0 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rprd1bQ9CSU0 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Rprd1bQ9CSU0 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rprd1bQ9CSU0 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rprd1bQ9CSU0 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rprd1bQ9CSU0 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rprd1bQ9CSU0 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rprd1bQ9CSU0 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rprd1bQ9CSU0 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rprd1bQ9CSU0 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rprd1bQ9CSU0 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rprd1bQ9CSU0 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rprd1bQ9CSU0 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rprd1bQ9CSU0 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rprd1bQ9CSU0 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rprd1bQ9CSU0 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Rprd1bQ9CSU0 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rprd1bQ9CSU0 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rprd1bQ9CSU0 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rprd1bQ9CSU0 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rprd1bQ9CSU0 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rprd1bQ9CSU0 Slc6a5-201ENSMUST00000056442 7065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rprd1bQ9CSU0 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rprd1bQ9CSU0 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rprd1bQ9CSU0 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rprd1bQ9CSU0 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rprd1bQ9CSU0 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rprd1bQ9CSU0 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rprd1bQ9CSU0 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rprd1bQ9CSU0 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rprd1bQ9CSU0 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rprd1bQ9CSU0 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rprd1bQ9CSU0 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rprd1bQ9CSU0 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rprd1bQ9CSU0 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rprd1bQ9CSU0 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rprd1bQ9CSU0 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rprd1bQ9CSU0 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rprd1bQ9CSU0 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rprd1bQ9CSU0 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Rprd1bQ9CSU0 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rprd1bQ9CSU0 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rprd1bQ9CSU0 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rprd1bQ9CSU0 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rprd1bQ9CSU0 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Rprd1bQ9CSU0 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rprd1bQ9CSU0 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rprd1bQ9CSU0 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rprd1bQ9CSU0 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rprd1bQ9CSU0 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Rprd1bQ9CSU0 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rprd1bQ9CSU0 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rprd1bQ9CSU0 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rprd1bQ9CSU0 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rprd1bQ9CSU0 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rprd1bQ9CSU0 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Rprd1bQ9CSU0 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rprd1bQ9CSU0 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rprd1bQ9CSU0 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rprd1bQ9CSU0 Ehbp1-202ENSMUST00000109563 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rprd1bQ9CSU0 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rprd1bQ9CSU0 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rprd1bQ9CSU0 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rprd1bQ9CSU0 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rprd1bQ9CSU0 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rprd1bQ9CSU0 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rprd1bQ9CSU0 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rprd1bQ9CSU0 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rprd1bQ9CSU0 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rprd1bQ9CSU0 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rprd1bQ9CSU0 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rprd1bQ9CSU0 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Rprd1bQ9CSU0 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rprd1bQ9CSU0 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rprd1bQ9CSU0 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rprd1bQ9CSU0 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rprd1bQ9CSU0 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rprd1bQ9CSU0 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Rprd1bQ9CSU0 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rprd1bQ9CSU0 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rprd1bQ9CSU0 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Rprd1bQ9CSU0 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rprd1bQ9CSU0 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rprd1bQ9CSU0 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Rprd1bQ9CSU0 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Rprd1bQ9CSU0 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Rprd1bQ9CSU0 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rprd1bQ9CSU0 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms