Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQY1

Atg12, Ubiquitin-like protein ATG12, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg12Q9CQY1 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Atg12Q9CQY1 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Atg12Q9CQY1 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Atg12Q9CQY1 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Atg12Q9CQY1 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Atg12Q9CQY1 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Atg12Q9CQY1 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Atg12Q9CQY1 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Atg12Q9CQY1 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Atg12Q9CQY1 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Atg12Q9CQY1 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Atg12Q9CQY1 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Atg12Q9CQY1 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Atg12Q9CQY1 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Atg12Q9CQY1 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Atg12Q9CQY1 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Atg12Q9CQY1 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Atg12Q9CQY1 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Atg12Q9CQY1 Slc12a7-201ENSMUST00000017900 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Atg12Q9CQY1 Myh6-201ENSMUST00000081857 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Atg12Q9CQY1 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Atg12Q9CQY1 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Atg12Q9CQY1 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Atg12Q9CQY1 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Atg12Q9CQY1 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Atg12Q9CQY1 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Atg12Q9CQY1 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Atg12Q9CQY1 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Atg12Q9CQY1 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Atg12Q9CQY1 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Atg12Q9CQY1 Pcnt-201ENSMUST00000001179 9331 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Atg12Q9CQY1 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Atg12Q9CQY1 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Atg12Q9CQY1 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Atg12Q9CQY1 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Atg12Q9CQY1 Ltbp1-202ENSMUST00000112514 4870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Atg12Q9CQY1 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Atg12Q9CQY1 Dennd4a-201ENSMUST00000038890 8645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Atg12Q9CQY1 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Atg12Q9CQY1 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Atg12Q9CQY1 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Atg12Q9CQY1 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Atg12Q9CQY1 Smarca2-209ENSMUST00000176030 5862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Atg12Q9CQY1 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Atg12Q9CQY1 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Atg12Q9CQY1 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Atg12Q9CQY1 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Atg12Q9CQY1 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Atg12Q9CQY1 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Atg12Q9CQY1 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Atg12Q9CQY1 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Atg12Q9CQY1 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Atg12Q9CQY1 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Atg12Q9CQY1 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Atg12Q9CQY1 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Atg12Q9CQY1 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Atg12Q9CQY1 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Atg12Q9CQY1 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Atg12Q9CQY1 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Atg12Q9CQY1 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Atg12Q9CQY1 Myh1-201ENSMUST00000018637 5938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Atg12Q9CQY1 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Atg12Q9CQY1 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Atg12Q9CQY1 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Atg12Q9CQY1 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Atg12Q9CQY1 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Atg12Q9CQY1 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Atg12Q9CQY1 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Atg12Q9CQY1 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Atg12Q9CQY1 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Atg12Q9CQY1 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Atg12Q9CQY1 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Atg12Q9CQY1 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Atg12Q9CQY1 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Atg12Q9CQY1 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Atg12Q9CQY1 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Atg12Q9CQY1 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Atg12Q9CQY1 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Atg12Q9CQY1 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Atg12Q9CQY1 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Atg12Q9CQY1 Ppp1r16b-202ENSMUST00000052927 6685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Atg12Q9CQY1 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Atg12Q9CQY1 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Atg12Q9CQY1 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Atg12Q9CQY1 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Atg12Q9CQY1 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Atg12Q9CQY1 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Atg12Q9CQY1 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Atg12Q9CQY1 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Atg12Q9CQY1 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Atg12Q9CQY1 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Atg12Q9CQY1 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Atg12Q9CQY1 Plin4-202ENSMUST00000190703 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Atg12Q9CQY1 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Atg12Q9CQY1 Fam26e-201ENSMUST00000069125 5323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Atg12Q9CQY1 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Atg12Q9CQY1 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Atg12Q9CQY1 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Atg12Q9CQY1 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Atg12Q9CQY1 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.6 ms