Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQW1

Ykt6, Synaptobrevin homolog YKT6, mousemouse

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Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ykt6Q9CQW1 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ykt6Q9CQW1 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ykt6Q9CQW1 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ykt6Q9CQW1 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Ykt6Q9CQW1 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ykt6Q9CQW1 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ykt6Q9CQW1 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Ykt6Q9CQW1 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Ykt6Q9CQW1 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ykt6Q9CQW1 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ykt6Q9CQW1 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ykt6Q9CQW1 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ykt6Q9CQW1 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ykt6Q9CQW1 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Ykt6Q9CQW1 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ykt6Q9CQW1 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Ykt6Q9CQW1 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ykt6Q9CQW1 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Ykt6Q9CQW1 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ykt6Q9CQW1 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Ykt6Q9CQW1 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ykt6Q9CQW1 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ykt6Q9CQW1 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ykt6Q9CQW1 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Ykt6Q9CQW1 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ykt6Q9CQW1 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Ykt6Q9CQW1 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Ykt6Q9CQW1 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Ykt6Q9CQW1 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Ykt6Q9CQW1 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ykt6Q9CQW1 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ykt6Q9CQW1 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ykt6Q9CQW1 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ykt6Q9CQW1 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ykt6Q9CQW1 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ykt6Q9CQW1 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ykt6Q9CQW1 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ykt6Q9CQW1 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ykt6Q9CQW1 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ykt6Q9CQW1 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Ykt6Q9CQW1 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ykt6Q9CQW1 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ykt6Q9CQW1 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ykt6Q9CQW1 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ykt6Q9CQW1 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ykt6Q9CQW1 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ykt6Q9CQW1 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ykt6Q9CQW1 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ykt6Q9CQW1 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ykt6Q9CQW1 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ykt6Q9CQW1 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ykt6Q9CQW1 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Ykt6Q9CQW1 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Ykt6Q9CQW1 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ykt6Q9CQW1 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ykt6Q9CQW1 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ykt6Q9CQW1 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ykt6Q9CQW1 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ykt6Q9CQW1 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ykt6Q9CQW1 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ykt6Q9CQW1 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ykt6Q9CQW1 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ykt6Q9CQW1 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ykt6Q9CQW1 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ykt6Q9CQW1 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
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Ykt6Q9CQW1 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ykt6Q9CQW1 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ykt6Q9CQW1 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ykt6Q9CQW1 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ykt6Q9CQW1 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Ykt6Q9CQW1 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ykt6Q9CQW1 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ykt6Q9CQW1 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ykt6Q9CQW1 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ykt6Q9CQW1 Fhl1-204ENSMUST00000114772 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ykt6Q9CQW1 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ykt6Q9CQW1 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ykt6Q9CQW1 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ykt6Q9CQW1 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ykt6Q9CQW1 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ykt6Q9CQW1 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ykt6Q9CQW1 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ykt6Q9CQW1 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ykt6Q9CQW1 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ykt6Q9CQW1 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ykt6Q9CQW1 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ykt6Q9CQW1 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ykt6Q9CQW1 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ykt6Q9CQW1 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ykt6Q9CQW1 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ykt6Q9CQW1 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ykt6Q9CQW1 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ykt6Q9CQW1 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ykt6Q9CQW1 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ykt6Q9CQW1 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ykt6Q9CQW1 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ykt6Q9CQW1 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ykt6Q9CQW1 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
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