Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQM5

Txndc17, Thioredoxin domain-containing protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Txndc17Q9CQM5 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Txndc17Q9CQM5 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Txndc17Q9CQM5 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Txndc17Q9CQM5 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Txndc17Q9CQM5 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Txndc17Q9CQM5 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Txndc17Q9CQM5 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Txndc17Q9CQM5 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Txndc17Q9CQM5 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Txndc17Q9CQM5 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Txndc17Q9CQM5 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Txndc17Q9CQM5 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Txndc17Q9CQM5 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Txndc17Q9CQM5 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Txndc17Q9CQM5 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Txndc17Q9CQM5 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Txndc17Q9CQM5 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Txndc17Q9CQM5 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Txndc17Q9CQM5 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Txndc17Q9CQM5 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Txndc17Q9CQM5 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Txndc17Q9CQM5 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Txndc17Q9CQM5 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Txndc17Q9CQM5 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Txndc17Q9CQM5 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Txndc17Q9CQM5 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Txndc17Q9CQM5 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Txndc17Q9CQM5 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Txndc17Q9CQM5 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Txndc17Q9CQM5 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Txndc17Q9CQM5 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Txndc17Q9CQM5 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Txndc17Q9CQM5 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Txndc17Q9CQM5 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Txndc17Q9CQM5 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Txndc17Q9CQM5 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Txndc17Q9CQM5 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Txndc17Q9CQM5 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Txndc17Q9CQM5 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Txndc17Q9CQM5 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Txndc17Q9CQM5 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Txndc17Q9CQM5 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Txndc17Q9CQM5 Plin4-202ENSMUST00000190703 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Txndc17Q9CQM5 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Txndc17Q9CQM5 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Txndc17Q9CQM5 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Txndc17Q9CQM5 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Txndc17Q9CQM5 Ppp1r16b-202ENSMUST00000052927 6685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Txndc17Q9CQM5 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Txndc17Q9CQM5 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Txndc17Q9CQM5 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Txndc17Q9CQM5 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Txndc17Q9CQM5 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Txndc17Q9CQM5 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Txndc17Q9CQM5 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Txndc17Q9CQM5 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Txndc17Q9CQM5 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Txndc17Q9CQM5 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Txndc17Q9CQM5 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Txndc17Q9CQM5 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Txndc17Q9CQM5 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Txndc17Q9CQM5 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Txndc17Q9CQM5 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Txndc17Q9CQM5 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Txndc17Q9CQM5 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Txndc17Q9CQM5 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Txndc17Q9CQM5 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Txndc17Q9CQM5 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Txndc17Q9CQM5 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Txndc17Q9CQM5 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Txndc17Q9CQM5 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Txndc17Q9CQM5 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Txndc17Q9CQM5 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Txndc17Q9CQM5 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Txndc17Q9CQM5 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Txndc17Q9CQM5 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Txndc17Q9CQM5 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Txndc17Q9CQM5 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Txndc17Q9CQM5 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Txndc17Q9CQM5 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Txndc17Q9CQM5 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Txndc17Q9CQM5 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Txndc17Q9CQM5 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Txndc17Q9CQM5 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Txndc17Q9CQM5 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Txndc17Q9CQM5 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Txndc17Q9CQM5 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Txndc17Q9CQM5 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Txndc17Q9CQM5 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Txndc17Q9CQM5 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Txndc17Q9CQM5 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Txndc17Q9CQM5 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Txndc17Q9CQM5 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Txndc17Q9CQM5 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Txndc17Q9CQM5 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC11.27□□□□□ -0.6
Txndc17Q9CQM5 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Txndc17Q9CQM5 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Txndc17Q9CQM5 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Txndc17Q9CQM5 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Txndc17Q9CQM5 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms