Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQH0

Pdzk1ip1, PDZK1-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Pdzk1ip1Q9CQH0 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Pdzk1ip1Q9CQH0 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cdadc1-208ENSMUST00000225839 3189 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Pdzk1ip1Q9CQH0 Iqsec1-201ENSMUST00000101151 6490 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm17244-201ENSMUST00000192482 3416 ntBASIC10.71□□□□□ -0.7
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Pdzk1ip1Q9CQH0 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Pdzk1ip1Q9CQH0 Olfr177-202ENSMUST00000217377 2401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pdzk1ip1Q9CQH0 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pdzk1ip1Q9CQH0 Lhx9-204ENSMUST00000112026 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pdzk1ip1Q9CQH0 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pdzk1ip1Q9CQH0 Chek1-202ENSMUST00000172702 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Pdzk1ip1Q9CQH0 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pdzk1ip1Q9CQH0 AU019823-201ENSMUST00000131351 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pdzk1ip1Q9CQH0 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pdzk1ip1Q9CQH0 Trim45-201ENSMUST00000037409 4612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pdzk1ip1Q9CQH0 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pdzk1ip1Q9CQH0 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pdzk1ip1Q9CQH0 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pdzk1ip1Q9CQH0 Armc3-202ENSMUST00000114640 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pdzk1ip1Q9CQH0 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pdzk1ip1Q9CQH0 Avpr2-202ENSMUST00000101470 2787 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nos3-201ENSMUST00000030834 4132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pdzk1ip1Q9CQH0 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pdzk1ip1Q9CQH0 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Pdzk1ip1Q9CQH0 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pdzk1ip1Q9CQH0 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pdzk1ip1Q9CQH0 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pdzk1ip1Q9CQH0 Odf2-209ENSMUST00000113764 2450 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pdzk1ip1Q9CQH0 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pdzk1ip1Q9CQH0 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pdzk1ip1Q9CQH0 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pdzk1ip1Q9CQH0 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mmel1-202ENSMUST00000080559 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pdzk1ip1Q9CQH0 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pdzk1ip1Q9CQH0 Igsf1-204ENSMUST00000114893 2671 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pdzk1ip1Q9CQH0 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pdzk1ip1Q9CQH0 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pdzk1ip1Q9CQH0 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pdzk1ip1Q9CQH0 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pdzk1ip1Q9CQH0 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ccl22-201ENSMUST00000034231 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pla2g4a-202ENSMUST00000111926 2835 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tns1-209ENSMUST00000187691 2813 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pdzk1ip1Q9CQH0 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pdzk1ip1Q9CQH0 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pdzk1ip1Q9CQH0 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pdzk1ip1Q9CQH0 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pdzk1ip1Q9CQH0 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
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