Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQF3

Nudt21, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudt21Q9CQF3 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nudt21Q9CQF3 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nudt21Q9CQF3 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nudt21Q9CQF3 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nudt21Q9CQF3 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nudt21Q9CQF3 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nudt21Q9CQF3 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nudt21Q9CQF3 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nudt21Q9CQF3 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nudt21Q9CQF3 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nudt21Q9CQF3 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nudt21Q9CQF3 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nudt21Q9CQF3 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nudt21Q9CQF3 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nudt21Q9CQF3 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nudt21Q9CQF3 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nudt21Q9CQF3 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nudt21Q9CQF3 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Nudt21Q9CQF3 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Nudt21Q9CQF3 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nudt21Q9CQF3 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nudt21Q9CQF3 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nudt21Q9CQF3 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nudt21Q9CQF3 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Nudt21Q9CQF3 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nudt21Q9CQF3 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Nudt21Q9CQF3 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nudt21Q9CQF3 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nudt21Q9CQF3 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nudt21Q9CQF3 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Nudt21Q9CQF3 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nudt21Q9CQF3 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nudt21Q9CQF3 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nudt21Q9CQF3 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nudt21Q9CQF3 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nudt21Q9CQF3 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nudt21Q9CQF3 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nudt21Q9CQF3 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nudt21Q9CQF3 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nudt21Q9CQF3 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nudt21Q9CQF3 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nudt21Q9CQF3 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nudt21Q9CQF3 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Nudt21Q9CQF3 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nudt21Q9CQF3 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nudt21Q9CQF3 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nudt21Q9CQF3 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nudt21Q9CQF3 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nudt21Q9CQF3 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nudt21Q9CQF3 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nudt21Q9CQF3 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nudt21Q9CQF3 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Nudt21Q9CQF3 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Nudt21Q9CQF3 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Nudt21Q9CQF3 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Nudt21Q9CQF3 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Nudt21Q9CQF3 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Nudt21Q9CQF3 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Nudt21Q9CQF3 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Nudt21Q9CQF3 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Nudt21Q9CQF3 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Nudt21Q9CQF3 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Nudt21Q9CQF3 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Nudt21Q9CQF3 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Nudt21Q9CQF3 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Nudt21Q9CQF3 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Nudt21Q9CQF3 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Nudt21Q9CQF3 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Nudt21Q9CQF3 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Nudt21Q9CQF3 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Nudt21Q9CQF3 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Nudt21Q9CQF3 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Nudt21Q9CQF3 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Nudt21Q9CQF3 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Nudt21Q9CQF3 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Nudt21Q9CQF3 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Nudt21Q9CQF3 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Nudt21Q9CQF3 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Nudt21Q9CQF3 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Nudt21Q9CQF3 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Nudt21Q9CQF3 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Nudt21Q9CQF3 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Nudt21Q9CQF3 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Nudt21Q9CQF3 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Nudt21Q9CQF3 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Nudt21Q9CQF3 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Nudt21Q9CQF3 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Nudt21Q9CQF3 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Nudt21Q9CQF3 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Nudt21Q9CQF3 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Nudt21Q9CQF3 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Nudt21Q9CQF3 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Nudt21Q9CQF3 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Nudt21Q9CQF3 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Nudt21Q9CQF3 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Nudt21Q9CQF3 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Nudt21Q9CQF3 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Nudt21Q9CQF3 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Nudt21Q9CQF3 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Nudt21Q9CQF3 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.6 ms