Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ73

Pkp2, Plakophilin 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp2Q9CQ73 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pkp2Q9CQ73 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pkp2Q9CQ73 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pkp2Q9CQ73 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pkp2Q9CQ73 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pkp2Q9CQ73 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pkp2Q9CQ73 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pkp2Q9CQ73 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pkp2Q9CQ73 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pkp2Q9CQ73 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pkp2Q9CQ73 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pkp2Q9CQ73 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pkp2Q9CQ73 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Pkp2Q9CQ73 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pkp2Q9CQ73 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pkp2Q9CQ73 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pkp2Q9CQ73 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pkp2Q9CQ73 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pkp2Q9CQ73 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pkp2Q9CQ73 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pkp2Q9CQ73 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pkp2Q9CQ73 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Pkp2Q9CQ73 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pkp2Q9CQ73 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pkp2Q9CQ73 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pkp2Q9CQ73 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pkp2Q9CQ73 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pkp2Q9CQ73 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pkp2Q9CQ73 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pkp2Q9CQ73 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pkp2Q9CQ73 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pkp2Q9CQ73 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pkp2Q9CQ73 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pkp2Q9CQ73 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Pkp2Q9CQ73 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Pkp2Q9CQ73 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pkp2Q9CQ73 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Pkp2Q9CQ73 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pkp2Q9CQ73 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pkp2Q9CQ73 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pkp2Q9CQ73 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pkp2Q9CQ73 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pkp2Q9CQ73 Nkx2-2os-202ENSMUST00000184407 458 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Pkp2Q9CQ73 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Pkp2Q9CQ73 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Pkp2Q9CQ73 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Pkp2Q9CQ73 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Pkp2Q9CQ73 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pkp2Q9CQ73 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pkp2Q9CQ73 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pkp2Q9CQ73 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pkp2Q9CQ73 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pkp2Q9CQ73 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pkp2Q9CQ73 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pkp2Q9CQ73 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pkp2Q9CQ73 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pkp2Q9CQ73 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pkp2Q9CQ73 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pkp2Q9CQ73 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pkp2Q9CQ73 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pkp2Q9CQ73 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pkp2Q9CQ73 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pkp2Q9CQ73 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pkp2Q9CQ73 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pkp2Q9CQ73 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pkp2Q9CQ73 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pkp2Q9CQ73 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pkp2Q9CQ73 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pkp2Q9CQ73 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Pkp2Q9CQ73 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Pkp2Q9CQ73 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pkp2Q9CQ73 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pkp2Q9CQ73 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Pkp2Q9CQ73 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pkp2Q9CQ73 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pkp2Q9CQ73 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pkp2Q9CQ73 Gm29787-201ENSMUST00000222129 849 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Pkp2Q9CQ73 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Pkp2Q9CQ73 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pkp2Q9CQ73 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pkp2Q9CQ73 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pkp2Q9CQ73 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pkp2Q9CQ73 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pkp2Q9CQ73 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pkp2Q9CQ73 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pkp2Q9CQ73 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pkp2Q9CQ73 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pkp2Q9CQ73 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pkp2Q9CQ73 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pkp2Q9CQ73 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pkp2Q9CQ73 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pkp2Q9CQ73 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pkp2Q9CQ73 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pkp2Q9CQ73 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pkp2Q9CQ73 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pkp2Q9CQ73 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pkp2Q9CQ73 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Pkp2Q9CQ73 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pkp2Q9CQ73 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pkp2Q9CQ73 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms