Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ18

Rnaseh2c, Ribonuclease H2 subunit C, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnaseh2cQ9CQ18 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rnaseh2cQ9CQ18 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rnaseh2cQ9CQ18 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Rnaseh2cQ9CQ18 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rnaseh2cQ9CQ18 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rnaseh2cQ9CQ18 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rnaseh2cQ9CQ18 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rnaseh2cQ9CQ18 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rnaseh2cQ9CQ18 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm10548-201ENSMUST00000097631 2629 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Rnaseh2cQ9CQ18 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Rnaseh2cQ9CQ18 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rnaseh2cQ9CQ18 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rnaseh2cQ9CQ18 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rnaseh2cQ9CQ18 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Rnaseh2cQ9CQ18 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rnaseh2cQ9CQ18 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rnaseh2cQ9CQ18 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rnaseh2cQ9CQ18 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rnaseh2cQ9CQ18 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rnaseh2cQ9CQ18 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rnaseh2cQ9CQ18 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rnaseh2cQ9CQ18 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rnaseh2cQ9CQ18 Gpr158-201ENSMUST00000055946 7171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rnaseh2cQ9CQ18 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm45532-201ENSMUST00000210342 3620 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Rnaseh2cQ9CQ18 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rnaseh2cQ9CQ18 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rnaseh2cQ9CQ18 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rnaseh2cQ9CQ18 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rnaseh2cQ9CQ18 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rnaseh2cQ9CQ18 Dnm3-202ENSMUST00000086074 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rnaseh2cQ9CQ18 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rnaseh2cQ9CQ18 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rnaseh2cQ9CQ18 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rnaseh2cQ9CQ18 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rnaseh2cQ9CQ18 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rnaseh2cQ9CQ18 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rnaseh2cQ9CQ18 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rnaseh2cQ9CQ18 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rnaseh2cQ9CQ18 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rnaseh2cQ9CQ18 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rnaseh2cQ9CQ18 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rnaseh2cQ9CQ18 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rnaseh2cQ9CQ18 Otof-202ENSMUST00000114747 6881 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rnaseh2cQ9CQ18 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rnaseh2cQ9CQ18 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rnaseh2cQ9CQ18 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
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Rnaseh2cQ9CQ18 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rnaseh2cQ9CQ18 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rnaseh2cQ9CQ18 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rnaseh2cQ9CQ18 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Rnaseh2cQ9CQ18 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Rnaseh2cQ9CQ18 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
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Rnaseh2cQ9CQ18 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
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Rnaseh2cQ9CQ18 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rnaseh2cQ9CQ18 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rnaseh2cQ9CQ18 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rnaseh2cQ9CQ18 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rnaseh2cQ9CQ18 Dopey2-207ENSMUST00000227156 7340 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Rnaseh2cQ9CQ18 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rnaseh2cQ9CQ18 Mecom-202ENSMUST00000108270 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rnaseh2cQ9CQ18 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rnaseh2cQ9CQ18 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Rnaseh2cQ9CQ18 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rnaseh2cQ9CQ18 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Rnaseh2cQ9CQ18 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rnaseh2cQ9CQ18 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rnaseh2cQ9CQ18 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rnaseh2cQ9CQ18 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm43064-201ENSMUST00000199710 3144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rnaseh2cQ9CQ18 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rnaseh2cQ9CQ18 Vipas39-203ENSMUST00000179379 2418 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rnaseh2cQ9CQ18 Alx1-203ENSMUST00000167156 2689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Rnaseh2cQ9CQ18 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rnaseh2cQ9CQ18 Tle3-202ENSMUST00000159050 2304 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rnaseh2cQ9CQ18 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rnaseh2cQ9CQ18 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rnaseh2cQ9CQ18 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rnaseh2cQ9CQ18 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
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