Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV0

Prpf8, Pre-mRNA-processing-splicing factor 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf8Q99PV0 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 Piezo2-202ENSMUST00000047480 10724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 Gm10961-201ENSMUST00000106703 144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.1 ms