Protein–RNA interactions for Protein: Q99PN3

Trim26, Tripartite motif-containing protein 26, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim26Q99PN3 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim26Q99PN3 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim26Q99PN3 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim26Q99PN3 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim26Q99PN3 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim26Q99PN3 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim26Q99PN3 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim26Q99PN3 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim26Q99PN3 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim26Q99PN3 Gm18558-201ENSMUST00000186253 1214 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim26Q99PN3 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim26Q99PN3 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim26Q99PN3 Gm45609-206ENSMUST00000210176 1023 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim26Q99PN3 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim26Q99PN3 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim26Q99PN3 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim26Q99PN3 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim26Q99PN3 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim26Q99PN3 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim26Q99PN3 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim26Q99PN3 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim26Q99PN3 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim26Q99PN3 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim26Q99PN3 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim26Q99PN3 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim26Q99PN3 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim26Q99PN3 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim26Q99PN3 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim26Q99PN3 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim26Q99PN3 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim26Q99PN3 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim26Q99PN3 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim26Q99PN3 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim26Q99PN3 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim26Q99PN3 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim26Q99PN3 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim26Q99PN3 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim26Q99PN3 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim26Q99PN3 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim26Q99PN3 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim26Q99PN3 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim26Q99PN3 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim26Q99PN3 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim26Q99PN3 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim26Q99PN3 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim26Q99PN3 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim26Q99PN3 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim26Q99PN3 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim26Q99PN3 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim26Q99PN3 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim26Q99PN3 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim26Q99PN3 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim26Q99PN3 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim26Q99PN3 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim26Q99PN3 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim26Q99PN3 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim26Q99PN3 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim26Q99PN3 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim26Q99PN3 Gm25007-201ENSMUST00000083808 133 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim26Q99PN3 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim26Q99PN3 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim26Q99PN3 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim26Q99PN3 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim26Q99PN3 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim26Q99PN3 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim26Q99PN3 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim26Q99PN3 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim26Q99PN3 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim26Q99PN3 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim26Q99PN3 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim26Q99PN3 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim26Q99PN3 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim26Q99PN3 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim26Q99PN3 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim26Q99PN3 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim26Q99PN3 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim26Q99PN3 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim26Q99PN3 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim26Q99PN3 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim26Q99PN3 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim26Q99PN3 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim26Q99PN3 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim26Q99PN3 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim26Q99PN3 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim26Q99PN3 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim26Q99PN3 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim26Q99PN3 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim26Q99PN3 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim26Q99PN3 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim26Q99PN3 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim26Q99PN3 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim26Q99PN3 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim26Q99PN3 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim26Q99PN3 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim26Q99PN3 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim26Q99PN3 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim26Q99PN3 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim26Q99PN3 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim26Q99PN3 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim26Q99PN3 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
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