Protein–RNA interactions for Protein: Q99PE5

Smim3, Small integral membrane protein 3, mousemouse

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Length 60 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim3Q99PE5 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smim3Q99PE5 Myh10-203ENSMUST00000102611 7791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smim3Q99PE5 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smim3Q99PE5 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smim3Q99PE5 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smim3Q99PE5 Gm20425-201ENSMUST00000166836 3028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smim3Q99PE5 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smim3Q99PE5 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smim3Q99PE5 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smim3Q99PE5 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smim3Q99PE5 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smim3Q99PE5 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smim3Q99PE5 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smim3Q99PE5 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smim3Q99PE5 Myom3-201ENSMUST00000105854 5575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smim3Q99PE5 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smim3Q99PE5 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Smim3Q99PE5 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smim3Q99PE5 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smim3Q99PE5 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smim3Q99PE5 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smim3Q99PE5 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smim3Q99PE5 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smim3Q99PE5 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Smim3Q99PE5 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Smim3Q99PE5 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Smim3Q99PE5 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smim3Q99PE5 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smim3Q99PE5 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Smim3Q99PE5 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smim3Q99PE5 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smim3Q99PE5 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smim3Q99PE5 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smim3Q99PE5 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smim3Q99PE5 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smim3Q99PE5 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smim3Q99PE5 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smim3Q99PE5 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smim3Q99PE5 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smim3Q99PE5 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smim3Q99PE5 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smim3Q99PE5 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smim3Q99PE5 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smim3Q99PE5 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smim3Q99PE5 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smim3Q99PE5 Gm4869-201ENSMUST00000197549 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smim3Q99PE5 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smim3Q99PE5 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smim3Q99PE5 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smim3Q99PE5 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smim3Q99PE5 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smim3Q99PE5 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smim3Q99PE5 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smim3Q99PE5 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smim3Q99PE5 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smim3Q99PE5 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smim3Q99PE5 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim3Q99PE5 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim3Q99PE5 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim3Q99PE5 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim3Q99PE5 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim3Q99PE5 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim3Q99PE5 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim3Q99PE5 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim3Q99PE5 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim3Q99PE5 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim3Q99PE5 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim3Q99PE5 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim3Q99PE5 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim3Q99PE5 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim3Q99PE5 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim3Q99PE5 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim3Q99PE5 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim3Q99PE5 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim3Q99PE5 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim3Q99PE5 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim3Q99PE5 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim3Q99PE5 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim3Q99PE5 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim3Q99PE5 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim3Q99PE5 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim3Q99PE5 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim3Q99PE5 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim3Q99PE5 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim3Q99PE5 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim3Q99PE5 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim3Q99PE5 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim3Q99PE5 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim3Q99PE5 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim3Q99PE5 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim3Q99PE5 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim3Q99PE5 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim3Q99PE5 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim3Q99PE5 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim3Q99PE5 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim3Q99PE5 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim3Q99PE5 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim3Q99PE5 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim3Q99PE5 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim3Q99PE5 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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