Protein–RNA interactions for Protein: Q99P88

Nup155, Nuclear pore complex protein Nup155, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup155Q99P88 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nup155Q99P88 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nup155Q99P88 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nup155Q99P88 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Nup155Q99P88 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nup155Q99P88 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nup155Q99P88 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nup155Q99P88 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nup155Q99P88 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nup155Q99P88 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nup155Q99P88 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nup155Q99P88 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nup155Q99P88 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nup155Q99P88 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nup155Q99P88 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nup155Q99P88 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nup155Q99P88 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Nup155Q99P88 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nup155Q99P88 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nup155Q99P88 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Nup155Q99P88 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Nup155Q99P88 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nup155Q99P88 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nup155Q99P88 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nup155Q99P88 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nup155Q99P88 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nup155Q99P88 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nup155Q99P88 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nup155Q99P88 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nup155Q99P88 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nup155Q99P88 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nup155Q99P88 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Nup155Q99P88 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nup155Q99P88 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Nup155Q99P88 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Nup155Q99P88 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nup155Q99P88 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nup155Q99P88 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nup155Q99P88 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nup155Q99P88 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Nup155Q99P88 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Nup155Q99P88 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Nup155Q99P88 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nup155Q99P88 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nup155Q99P88 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Nup155Q99P88 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Nup155Q99P88 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nup155Q99P88 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nup155Q99P88 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nup155Q99P88 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nup155Q99P88 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nup155Q99P88 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nup155Q99P88 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nup155Q99P88 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nup155Q99P88 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nup155Q99P88 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nup155Q99P88 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nup155Q99P88 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nup155Q99P88 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nup155Q99P88 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nup155Q99P88 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nup155Q99P88 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nup155Q99P88 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nup155Q99P88 Zfp157-203ENSMUST00000110912 886 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nup155Q99P88 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Nup155Q99P88 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nup155Q99P88 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Nup155Q99P88 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nup155Q99P88 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nup155Q99P88 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nup155Q99P88 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nup155Q99P88 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nup155Q99P88 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nup155Q99P88 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nup155Q99P88 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nup155Q99P88 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nup155Q99P88 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nup155Q99P88 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nup155Q99P88 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nup155Q99P88 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nup155Q99P88 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nup155Q99P88 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nup155Q99P88 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nup155Q99P88 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nup155Q99P88 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nup155Q99P88 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nup155Q99P88 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nup155Q99P88 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nup155Q99P88 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nup155Q99P88 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nup155Q99P88 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nup155Q99P88 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nup155Q99P88 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nup155Q99P88 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nup155Q99P88 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nup155Q99P88 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nup155Q99P88 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Nup155Q99P88 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nup155Q99P88 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nup155Q99P88 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.8 ms