Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF2

Nsmf, NMDA receptor synaptonuclear signaling and neuronal migration factor, mousemouse

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Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NsmfQ99NF2 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NsmfQ99NF2 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NsmfQ99NF2 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NsmfQ99NF2 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NsmfQ99NF2 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NsmfQ99NF2 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NsmfQ99NF2 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
NsmfQ99NF2 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
NsmfQ99NF2 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
NsmfQ99NF2 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
NsmfQ99NF2 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
NsmfQ99NF2 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
NsmfQ99NF2 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NsmfQ99NF2 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NsmfQ99NF2 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
NsmfQ99NF2 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
NsmfQ99NF2 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
NsmfQ99NF2 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
NsmfQ99NF2 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
NsmfQ99NF2 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NsmfQ99NF2 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NsmfQ99NF2 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
NsmfQ99NF2 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
NsmfQ99NF2 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
NsmfQ99NF2 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NsmfQ99NF2 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NsmfQ99NF2 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NsmfQ99NF2 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NsmfQ99NF2 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NsmfQ99NF2 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
NsmfQ99NF2 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NsmfQ99NF2 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
NsmfQ99NF2 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NsmfQ99NF2 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NsmfQ99NF2 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
NsmfQ99NF2 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NsmfQ99NF2 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
NsmfQ99NF2 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NsmfQ99NF2 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NsmfQ99NF2 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
NsmfQ99NF2 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NsmfQ99NF2 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
NsmfQ99NF2 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NsmfQ99NF2 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
NsmfQ99NF2 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
NsmfQ99NF2 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NsmfQ99NF2 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
NsmfQ99NF2 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NsmfQ99NF2 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
NsmfQ99NF2 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NsmfQ99NF2 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NsmfQ99NF2 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NsmfQ99NF2 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NsmfQ99NF2 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NsmfQ99NF2 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
NsmfQ99NF2 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NsmfQ99NF2 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NsmfQ99NF2 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NsmfQ99NF2 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NsmfQ99NF2 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NsmfQ99NF2 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NsmfQ99NF2 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
NsmfQ99NF2 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NsmfQ99NF2 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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NsmfQ99NF2 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NsmfQ99NF2 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NsmfQ99NF2 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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NsmfQ99NF2 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NsmfQ99NF2 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NsmfQ99NF2 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NsmfQ99NF2 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NsmfQ99NF2 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NsmfQ99NF2 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
NsmfQ99NF2 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NsmfQ99NF2 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NsmfQ99NF2 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NsmfQ99NF2 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
NsmfQ99NF2 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NsmfQ99NF2 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
NsmfQ99NF2 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
NsmfQ99NF2 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NsmfQ99NF2 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NsmfQ99NF2 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
NsmfQ99NF2 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NsmfQ99NF2 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
NsmfQ99NF2 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
NsmfQ99NF2 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
NsmfQ99NF2 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
NsmfQ99NF2 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
NsmfQ99NF2 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NsmfQ99NF2 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NsmfQ99NF2 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NsmfQ99NF2 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
NsmfQ99NF2 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NsmfQ99NF2 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
NsmfQ99NF2 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NsmfQ99NF2 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NsmfQ99NF2 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
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