Protein–RNA interactions for Protein: Q99N89

Mrpl43, 39S ribosomal protein L43, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl43Q99N89 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Mrpl43Q99N89 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Mrpl43Q99N89 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Mrpl43Q99N89 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Mrpl43Q99N89 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Mrpl43Q99N89 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Mrpl43Q99N89 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Mrpl43Q99N89 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Mrpl43Q99N89 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Mrpl43Q99N89 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Mrpl43Q99N89 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Mrpl43Q99N89 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Mrpl43Q99N89 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Mrpl43Q99N89 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Mrpl43Q99N89 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Mrpl43Q99N89 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Mrpl43Q99N89 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Mrpl43Q99N89 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Mrpl43Q99N89 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Mrpl43Q99N89 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Mrpl43Q99N89 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Mrpl43Q99N89 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Mrpl43Q99N89 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Mrpl43Q99N89 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Mrpl43Q99N89 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Mrpl43Q99N89 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Mrpl43Q99N89 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Mrpl43Q99N89 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Mrpl43Q99N89 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Mrpl43Q99N89 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Mrpl43Q99N89 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Mrpl43Q99N89 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Mrpl43Q99N89 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Mrpl43Q99N89 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Mrpl43Q99N89 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Mrpl43Q99N89 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Mrpl43Q99N89 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Mrpl43Q99N89 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Mrpl43Q99N89 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Mrpl43Q99N89 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mrpl43Q99N89 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mrpl43Q99N89 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mrpl43Q99N89 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mrpl43Q99N89 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Mrpl43Q99N89 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mrpl43Q99N89 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mrpl43Q99N89 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mrpl43Q99N89 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Mrpl43Q99N89 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Mrpl43Q99N89 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mrpl43Q99N89 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mrpl43Q99N89 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Mrpl43Q99N89 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mrpl43Q99N89 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mrpl43Q99N89 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Mrpl43Q99N89 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mrpl43Q99N89 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Mrpl43Q99N89 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Mrpl43Q99N89 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Mrpl43Q99N89 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mrpl43Q99N89 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Mrpl43Q99N89 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Mrpl43Q99N89 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mrpl43Q99N89 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mrpl43Q99N89 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mrpl43Q99N89 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mrpl43Q99N89 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mrpl43Q99N89 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mrpl43Q99N89 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mrpl43Q99N89 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mrpl43Q99N89 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mrpl43Q99N89 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mrpl43Q99N89 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mrpl43Q99N89 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mrpl43Q99N89 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mrpl43Q99N89 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mrpl43Q99N89 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mrpl43Q99N89 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mrpl43Q99N89 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mrpl43Q99N89 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mrpl43Q99N89 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mrpl43Q99N89 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mrpl43Q99N89 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mrpl43Q99N89 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mrpl43Q99N89 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mrpl43Q99N89 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mrpl43Q99N89 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mrpl43Q99N89 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mrpl43Q99N89 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mrpl43Q99N89 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mrpl43Q99N89 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mrpl43Q99N89 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mrpl43Q99N89 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mrpl43Q99N89 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mrpl43Q99N89 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mrpl43Q99N89 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mrpl43Q99N89 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mrpl43Q99N89 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mrpl43Q99N89 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mrpl43Q99N89 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms