Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG0

Usp16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp16Q99LG0 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp16Q99LG0 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp16Q99LG0 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp16Q99LG0 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp16Q99LG0 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp16Q99LG0 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp16Q99LG0 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp16Q99LG0 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp16Q99LG0 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp16Q99LG0 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp16Q99LG0 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp16Q99LG0 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp16Q99LG0 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp16Q99LG0 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp16Q99LG0 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp16Q99LG0 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp16Q99LG0 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp16Q99LG0 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp16Q99LG0 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp16Q99LG0 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp16Q99LG0 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp16Q99LG0 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp16Q99LG0 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp16Q99LG0 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp16Q99LG0 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp16Q99LG0 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp16Q99LG0 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp16Q99LG0 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp16Q99LG0 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp16Q99LG0 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp16Q99LG0 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp16Q99LG0 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp16Q99LG0 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp16Q99LG0 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp16Q99LG0 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp16Q99LG0 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp16Q99LG0 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp16Q99LG0 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp16Q99LG0 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp16Q99LG0 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp16Q99LG0 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp16Q99LG0 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp16Q99LG0 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp16Q99LG0 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp16Q99LG0 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp16Q99LG0 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp16Q99LG0 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp16Q99LG0 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp16Q99LG0 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp16Q99LG0 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp16Q99LG0 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp16Q99LG0 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp16Q99LG0 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp16Q99LG0 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp16Q99LG0 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp16Q99LG0 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp16Q99LG0 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp16Q99LG0 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp16Q99LG0 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp16Q99LG0 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp16Q99LG0 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp16Q99LG0 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp16Q99LG0 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp16Q99LG0 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp16Q99LG0 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp16Q99LG0 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp16Q99LG0 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp16Q99LG0 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp16Q99LG0 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp16Q99LG0 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp16Q99LG0 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp16Q99LG0 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp16Q99LG0 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp16Q99LG0 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp16Q99LG0 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp16Q99LG0 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp16Q99LG0 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp16Q99LG0 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp16Q99LG0 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp16Q99LG0 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp16Q99LG0 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp16Q99LG0 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp16Q99LG0 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp16Q99LG0 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp16Q99LG0 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp16Q99LG0 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp16Q99LG0 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp16Q99LG0 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp16Q99LG0 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp16Q99LG0 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp16Q99LG0 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp16Q99LG0 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp16Q99LG0 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp16Q99LG0 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp16Q99LG0 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp16Q99LG0 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp16Q99LG0 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp16Q99LG0 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp16Q99LG0 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp16Q99LG0 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.5 ms