Protein–RNA interactions for Protein: Q99LF4

Rtcb, tRNA-splicing ligase RtcB homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RtcbQ99LF4 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RtcbQ99LF4 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RtcbQ99LF4 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RtcbQ99LF4 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RtcbQ99LF4 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RtcbQ99LF4 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RtcbQ99LF4 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RtcbQ99LF4 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RtcbQ99LF4 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RtcbQ99LF4 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RtcbQ99LF4 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RtcbQ99LF4 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RtcbQ99LF4 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RtcbQ99LF4 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RtcbQ99LF4 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RtcbQ99LF4 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RtcbQ99LF4 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RtcbQ99LF4 Rps9-203ENSMUST00000108624 478 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RtcbQ99LF4 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RtcbQ99LF4 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RtcbQ99LF4 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RtcbQ99LF4 Mir1901-201ENSMUST00000122616 78 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RtcbQ99LF4 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RtcbQ99LF4 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RtcbQ99LF4 Rsph14-206ENSMUST00000166088 1203 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RtcbQ99LF4 Rsph14-207ENSMUST00000179546 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RtcbQ99LF4 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RtcbQ99LF4 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RtcbQ99LF4 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RtcbQ99LF4 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RtcbQ99LF4 Gm45460-201ENSMUST00000211385 1038 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RtcbQ99LF4 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RtcbQ99LF4 Hopx-201ENSMUST00000081964 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RtcbQ99LF4 Rsph14-201ENSMUST00000009214 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RtcbQ99LF4 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RtcbQ99LF4 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RtcbQ99LF4 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RtcbQ99LF4 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RtcbQ99LF4 Ccdc42os-201ENSMUST00000148019 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RtcbQ99LF4 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RtcbQ99LF4 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RtcbQ99LF4 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RtcbQ99LF4 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RtcbQ99LF4 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RtcbQ99LF4 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RtcbQ99LF4 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RtcbQ99LF4 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RtcbQ99LF4 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RtcbQ99LF4 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RtcbQ99LF4 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RtcbQ99LF4 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RtcbQ99LF4 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RtcbQ99LF4 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RtcbQ99LF4 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RtcbQ99LF4 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RtcbQ99LF4 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RtcbQ99LF4 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RtcbQ99LF4 Gstm4-202ENSMUST00000106670 777 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RtcbQ99LF4 Pmp22-202ENSMUST00000108700 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RtcbQ99LF4 Gm11340-201ENSMUST00000119226 412 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RtcbQ99LF4 Adap2os-201ENSMUST00000140556 984 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RtcbQ99LF4 Crhr2-204ENSMUST00000164012 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RtcbQ99LF4 AC124457.1-201ENSMUST00000198845 120 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RtcbQ99LF4 Gm37419-201ENSMUST00000210705 114 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RtcbQ99LF4 Gm9873-201ENSMUST00000063891 1097 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RtcbQ99LF4 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RtcbQ99LF4 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RtcbQ99LF4 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RtcbQ99LF4 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RtcbQ99LF4 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RtcbQ99LF4 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RtcbQ99LF4 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RtcbQ99LF4 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RtcbQ99LF4 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RtcbQ99LF4 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RtcbQ99LF4 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RtcbQ99LF4 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RtcbQ99LF4 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RtcbQ99LF4 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RtcbQ99LF4 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RtcbQ99LF4 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RtcbQ99LF4 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RtcbQ99LF4 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RtcbQ99LF4 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RtcbQ99LF4 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RtcbQ99LF4 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RtcbQ99LF4 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RtcbQ99LF4 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RtcbQ99LF4 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RtcbQ99LF4 Mocs2-205ENSMUST00000165022 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RtcbQ99LF4 Agtpbp1-216ENSMUST00000168821 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RtcbQ99LF4 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RtcbQ99LF4 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RtcbQ99LF4 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RtcbQ99LF4 Gm23771-201ENSMUST00000178702 110 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RtcbQ99LF4 Gm27910-201ENSMUST00000185004 107 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RtcbQ99LF4 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RtcbQ99LF4 Gm5542-201ENSMUST00000195485 1089 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RtcbQ99LF4 Gm34809-203ENSMUST00000222945 509 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RtcbQ99LF4 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.8 ms