Protein–RNA interactions for Protein: Q99KN2

Ciao1, Probable cytosolic iron-sulfur protein assembly protein CIAO1, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ciao1Q99KN2 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ciao1Q99KN2 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ciao1Q99KN2 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ciao1Q99KN2 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ciao1Q99KN2 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ciao1Q99KN2 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ciao1Q99KN2 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ciao1Q99KN2 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ciao1Q99KN2 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ciao1Q99KN2 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ciao1Q99KN2 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ciao1Q99KN2 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ciao1Q99KN2 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ciao1Q99KN2 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ciao1Q99KN2 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ciao1Q99KN2 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ciao1Q99KN2 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ciao1Q99KN2 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ciao1Q99KN2 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ciao1Q99KN2 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ciao1Q99KN2 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ciao1Q99KN2 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ciao1Q99KN2 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ciao1Q99KN2 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ciao1Q99KN2 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ciao1Q99KN2 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ciao1Q99KN2 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ciao1Q99KN2 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Ciao1Q99KN2 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Ciao1Q99KN2 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Ciao1Q99KN2 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Ciao1Q99KN2 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Ciao1Q99KN2 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Ciao1Q99KN2 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Ciao1Q99KN2 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Ciao1Q99KN2 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Ciao1Q99KN2 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Ciao1Q99KN2 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Ciao1Q99KN2 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Ciao1Q99KN2 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Ciao1Q99KN2 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Ciao1Q99KN2 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ciao1Q99KN2 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Ciao1Q99KN2 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ciao1Q99KN2 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ciao1Q99KN2 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ciao1Q99KN2 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ciao1Q99KN2 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ciao1Q99KN2 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ciao1Q99KN2 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ciao1Q99KN2 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ciao1Q99KN2 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ciao1Q99KN2 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ciao1Q99KN2 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ciao1Q99KN2 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ciao1Q99KN2 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ciao1Q99KN2 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ciao1Q99KN2 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ciao1Q99KN2 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ciao1Q99KN2 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ciao1Q99KN2 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ciao1Q99KN2 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ciao1Q99KN2 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ciao1Q99KN2 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ciao1Q99KN2 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ciao1Q99KN2 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ciao1Q99KN2 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Ciao1Q99KN2 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Ciao1Q99KN2 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ciao1Q99KN2 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ciao1Q99KN2 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ciao1Q99KN2 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ciao1Q99KN2 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ciao1Q99KN2 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ciao1Q99KN2 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ciao1Q99KN2 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Ciao1Q99KN2 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Ciao1Q99KN2 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ciao1Q99KN2 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ciao1Q99KN2 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ciao1Q99KN2 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ciao1Q99KN2 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ciao1Q99KN2 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ciao1Q99KN2 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Ciao1Q99KN2 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ciao1Q99KN2 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ciao1Q99KN2 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ciao1Q99KN2 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ciao1Q99KN2 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ciao1Q99KN2 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ciao1Q99KN2 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ciao1Q99KN2 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ciao1Q99KN2 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ciao1Q99KN2 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ciao1Q99KN2 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ciao1Q99KN2 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ciao1Q99KN2 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ciao1Q99KN2 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ciao1Q99KN2 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ciao1Q99KN2 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.9 ms