Protein–RNA interactions for Protein: Q99J19

Smim11a, Small integral membrane protein 11A, mousemouse

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Length 55 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim11aQ99J19 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Smim11aQ99J19 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Smim11aQ99J19 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Smim11aQ99J19 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Smim11aQ99J19 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Smim11aQ99J19 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Smim11aQ99J19 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Smim11aQ99J19 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Smim11aQ99J19 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Smim11aQ99J19 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Smim11aQ99J19 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Smim11aQ99J19 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Smim11aQ99J19 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Smim11aQ99J19 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Smim11aQ99J19 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Smim11aQ99J19 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Smim11aQ99J19 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Smim11aQ99J19 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Smim11aQ99J19 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Smim11aQ99J19 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Smim11aQ99J19 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Smim11aQ99J19 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Smim11aQ99J19 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Smim11aQ99J19 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Smim11aQ99J19 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Smim11aQ99J19 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Smim11aQ99J19 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Smim11aQ99J19 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Smim11aQ99J19 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Smim11aQ99J19 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Smim11aQ99J19 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Smim11aQ99J19 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Smim11aQ99J19 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Smim11aQ99J19 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Smim11aQ99J19 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Smim11aQ99J19 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
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Smim11aQ99J19 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Smim11aQ99J19 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Smim11aQ99J19 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Smim11aQ99J19 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Smim11aQ99J19 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Smim11aQ99J19 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Smim11aQ99J19 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Smim11aQ99J19 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Smim11aQ99J19 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Smim11aQ99J19 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Smim11aQ99J19 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Smim11aQ99J19 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Smim11aQ99J19 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
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Smim11aQ99J19 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Smim11aQ99J19 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Smim11aQ99J19 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Smim11aQ99J19 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Smim11aQ99J19 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
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Smim11aQ99J19 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
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Smim11aQ99J19 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Smim11aQ99J19 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Smim11aQ99J19 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Smim11aQ99J19 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
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Smim11aQ99J19 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Smim11aQ99J19 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Smim11aQ99J19 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Smim11aQ99J19 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Smim11aQ99J19 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Smim11aQ99J19 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Smim11aQ99J19 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Smim11aQ99J19 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Smim11aQ99J19 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Smim11aQ99J19 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Smim11aQ99J19 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Smim11aQ99J19 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Smim11aQ99J19 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Smim11aQ99J19 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Smim11aQ99J19 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Smim11aQ99J19 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Smim11aQ99J19 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Smim11aQ99J19 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Smim11aQ99J19 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Smim11aQ99J19 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Smim11aQ99J19 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Smim11aQ99J19 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
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