Protein–RNA interactions for Protein: Q99J10

Ctu1, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctu1Q99J10 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ctu1Q99J10 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ctu1Q99J10 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ctu1Q99J10 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ctu1Q99J10 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ctu1Q99J10 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ctu1Q99J10 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ctu1Q99J10 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ctu1Q99J10 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ctu1Q99J10 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ctu1Q99J10 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ctu1Q99J10 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Ctu1Q99J10 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ctu1Q99J10 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ctu1Q99J10 H1foo-203ENSMUST00000161969 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ctu1Q99J10 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Ctu1Q99J10 Gm28215-201ENSMUST00000186146 346 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ctu1Q99J10 Gm7600-201ENSMUST00000209657 785 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Ctu1Q99J10 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Ctu1Q99J10 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ctu1Q99J10 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ctu1Q99J10 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ctu1Q99J10 Gm9387-201ENSMUST00000098624 1320 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Ctu1Q99J10 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ctu1Q99J10 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ctu1Q99J10 Bbs5-202ENSMUST00000112286 1397 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ctu1Q99J10 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ctu1Q99J10 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ctu1Q99J10 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ctu1Q99J10 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Ctu1Q99J10 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ctu1Q99J10 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ctu1Q99J10 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ctu1Q99J10 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ctu1Q99J10 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ctu1Q99J10 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ctu1Q99J10 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ctu1Q99J10 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ctu1Q99J10 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ctu1Q99J10 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ctu1Q99J10 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ctu1Q99J10 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ctu1Q99J10 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ctu1Q99J10 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ctu1Q99J10 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ctu1Q99J10 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ctu1Q99J10 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ctu1Q99J10 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ctu1Q99J10 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ctu1Q99J10 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ctu1Q99J10 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ctu1Q99J10 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ctu1Q99J10 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ctu1Q99J10 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ctu1Q99J10 Apoo-202ENSMUST00000113896 1032 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ctu1Q99J10 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Ctu1Q99J10 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Ctu1Q99J10 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ctu1Q99J10 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ctu1Q99J10 Rdh9-203ENSMUST00000136223 1276 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ctu1Q99J10 C730034F03Rik-201ENSMUST00000168646 1280 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ctu1Q99J10 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ctu1Q99J10 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ctu1Q99J10 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ctu1Q99J10 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ctu1Q99J10 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Ctu1Q99J10 Gm29676-202ENSMUST00000222409 364 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ctu1Q99J10 Mrpl30-201ENSMUST00000027256 969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ctu1Q99J10 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Ctu1Q99J10 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ctu1Q99J10 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Ctu1Q99J10 Actg-ps1-201ENSMUST00000099636 1124 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Ctu1Q99J10 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ctu1Q99J10 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ctu1Q99J10 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ctu1Q99J10 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ctu1Q99J10 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ctu1Q99J10 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ctu1Q99J10 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Ctu1Q99J10 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ctu1Q99J10 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ctu1Q99J10 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Ctu1Q99J10 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Ctu1Q99J10 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Ctu1Q99J10 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Ctu1Q99J10 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Ctu1Q99J10 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Ctu1Q99J10 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Ctu1Q99J10 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ctu1Q99J10 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ctu1Q99J10 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Ctu1Q99J10 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ctu1Q99J10 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ctu1Q99J10 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ctu1Q99J10 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Ctu1Q99J10 Taf9-201ENSMUST00000167256 1230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ctu1Q99J10 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ctu1Q99J10 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ctu1Q99J10 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ctu1Q99J10 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 139 ms