Protein–RNA interactions for Protein: Q99388

Csprs, Component of Sp100-rs, mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CsprsQ99388 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
CsprsQ99388 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
CsprsQ99388 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
CsprsQ99388 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
CsprsQ99388 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
CsprsQ99388 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
CsprsQ99388 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
CsprsQ99388 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
CsprsQ99388 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
CsprsQ99388 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
CsprsQ99388 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
CsprsQ99388 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
CsprsQ99388 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
CsprsQ99388 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
CsprsQ99388 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
CsprsQ99388 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
CsprsQ99388 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
CsprsQ99388 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
CsprsQ99388 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
CsprsQ99388 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
CsprsQ99388 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
CsprsQ99388 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
CsprsQ99388 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
CsprsQ99388 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
CsprsQ99388 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
CsprsQ99388 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
CsprsQ99388 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
CsprsQ99388 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
CsprsQ99388 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
CsprsQ99388 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
CsprsQ99388 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
CsprsQ99388 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
CsprsQ99388 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
CsprsQ99388 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
CsprsQ99388 Cad-204ENSMUST00000201182 6529 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
CsprsQ99388 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
CsprsQ99388 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
CsprsQ99388 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
CsprsQ99388 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
CsprsQ99388 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
CsprsQ99388 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
CsprsQ99388 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
CsprsQ99388 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
CsprsQ99388 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
CsprsQ99388 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
CsprsQ99388 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
CsprsQ99388 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
CsprsQ99388 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
CsprsQ99388 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
CsprsQ99388 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
CsprsQ99388 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
CsprsQ99388 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
CsprsQ99388 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
CsprsQ99388 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
CsprsQ99388 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
CsprsQ99388 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
CsprsQ99388 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
CsprsQ99388 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
CsprsQ99388 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
CsprsQ99388 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
CsprsQ99388 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
CsprsQ99388 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
CsprsQ99388 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
CsprsQ99388 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
CsprsQ99388 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
CsprsQ99388 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
CsprsQ99388 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
CsprsQ99388 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
CsprsQ99388 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
CsprsQ99388 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
CsprsQ99388 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
CsprsQ99388 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
CsprsQ99388 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
CsprsQ99388 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
CsprsQ99388 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
CsprsQ99388 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
CsprsQ99388 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
CsprsQ99388 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
CsprsQ99388 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
CsprsQ99388 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
CsprsQ99388 Myh10-203ENSMUST00000102611 7791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
CsprsQ99388 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
CsprsQ99388 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CsprsQ99388 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CsprsQ99388 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CsprsQ99388 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
CsprsQ99388 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CsprsQ99388 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CsprsQ99388 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CsprsQ99388 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
CsprsQ99388 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
CsprsQ99388 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CsprsQ99388 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CsprsQ99388 Gm32036-201ENSMUST00000221484 2638 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
CsprsQ99388 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CsprsQ99388 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CsprsQ99388 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CsprsQ99388 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CsprsQ99388 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CsprsQ99388 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.6 ms