Protein–RNA interactions for Protein: Q925F3

Rnf144a, E3 ubiquitin-protein ligase RNF144A, mousemouse

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Length 292 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf144aQ925F3 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rnf144aQ925F3 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rnf144aQ925F3 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rnf144aQ925F3 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rnf144aQ925F3 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rnf144aQ925F3 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rnf144aQ925F3 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rnf144aQ925F3 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rnf144aQ925F3 Rangap1-202ENSMUST00000170134 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rnf144aQ925F3 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Rnf144aQ925F3 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Rnf144aQ925F3 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Rnf144aQ925F3 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Rnf144aQ925F3 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Rnf144aQ925F3 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Rnf144aQ925F3 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Rnf144aQ925F3 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Rnf144aQ925F3 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Rnf144aQ925F3 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Rnf144aQ925F3 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Rnf144aQ925F3 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Rnf144aQ925F3 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rnf144aQ925F3 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rnf144aQ925F3 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rnf144aQ925F3 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rnf144aQ925F3 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rnf144aQ925F3 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rnf144aQ925F3 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rnf144aQ925F3 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Rnf144aQ925F3 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Rnf144aQ925F3 AC153961.1-201ENSMUST00000217760 385 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Rnf144aQ925F3 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rnf144aQ925F3 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rnf144aQ925F3 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rnf144aQ925F3 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rnf144aQ925F3 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rnf144aQ925F3 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rnf144aQ925F3 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Rnf144aQ925F3 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rnf144aQ925F3 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rnf144aQ925F3 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rnf144aQ925F3 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rnf144aQ925F3 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rnf144aQ925F3 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rnf144aQ925F3 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rnf144aQ925F3 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rnf144aQ925F3 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rnf144aQ925F3 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rnf144aQ925F3 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rnf144aQ925F3 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rnf144aQ925F3 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rnf144aQ925F3 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rnf144aQ925F3 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rnf144aQ925F3 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rnf144aQ925F3 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rnf144aQ925F3 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rnf144aQ925F3 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rnf144aQ925F3 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rnf144aQ925F3 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
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Rnf144aQ925F3 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rnf144aQ925F3 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
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Rnf144aQ925F3 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rnf144aQ925F3 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rnf144aQ925F3 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
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Rnf144aQ925F3 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rnf144aQ925F3 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rnf144aQ925F3 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
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Rnf144aQ925F3 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rnf144aQ925F3 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Rnf144aQ925F3 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Rnf144aQ925F3 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rnf144aQ925F3 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rnf144aQ925F3 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rnf144aQ925F3 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Rnf144aQ925F3 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rnf144aQ925F3 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rnf144aQ925F3 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rnf144aQ925F3 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rnf144aQ925F3 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rnf144aQ925F3 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rnf144aQ925F3 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rnf144aQ925F3 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rnf144aQ925F3 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Rnf144aQ925F3 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rnf144aQ925F3 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rnf144aQ925F3 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rnf144aQ925F3 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rnf144aQ925F3 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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