Protein–RNA interactions for Protein: Q923L3

Csmd1, CUB and sushi domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 3,564 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csmd1Q923L3 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Csmd1Q923L3 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Csmd1Q923L3 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Csmd1Q923L3 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Csmd1Q923L3 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Csmd1Q923L3 4930486L24Rik-201ENSMUST00000091569 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Csmd1Q923L3 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Csmd1Q923L3 Rhox3d-ps-201ENSMUST00000119181 825 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Csmd1Q923L3 Gm3250-201ENSMUST00000167358 693 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Csmd1Q923L3 Gm3238-201ENSMUST00000168298 693 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Csmd1Q923L3 Mir99ahg-209ENSMUST00000182820 835 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Csmd1Q923L3 Gm10318-202ENSMUST00000217996 639 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Csmd1Q923L3 Sec13-201ENSMUST00000032440 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Csmd1Q923L3 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Csmd1Q923L3 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Csmd1Q923L3 Cipc-208ENSMUST00000189246 1454 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Csmd1Q923L3 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Csmd1Q923L3 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Csmd1Q923L3 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Csmd1Q923L3 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Csmd1Q923L3 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Csmd1Q923L3 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Csmd1Q923L3 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Csmd1Q923L3 Gm24791-201ENSMUST00000104284 131 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Csmd1Q923L3 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Csmd1Q923L3 Gm16538-201ENSMUST00000162407 442 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Csmd1Q923L3 Gm3551-201ENSMUST00000190750 664 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Csmd1Q923L3 Gm19587-201ENSMUST00000191395 545 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Csmd1Q923L3 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Csmd1Q923L3 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Csmd1Q923L3 Mcts2-201ENSMUST00000062148 917 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Csmd1Q923L3 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Csmd1Q923L3 Lyplal1-201ENSMUST00000045388 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Csmd1Q923L3 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Csmd1Q923L3 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Csmd1Q923L3 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Csmd1Q923L3 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Csmd1Q923L3 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Csmd1Q923L3 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Csmd1Q923L3 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Csmd1Q923L3 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Csmd1Q923L3 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Csmd1Q923L3 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Csmd1Q923L3 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Csmd1Q923L3 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Csmd1Q923L3 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Csmd1Q923L3 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Csmd1Q923L3 Akr1b8-201ENSMUST00000038406 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Csmd1Q923L3 Gm11560-201ENSMUST00000117567 948 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Csmd1Q923L3 Gm12663-201ENSMUST00000118481 958 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Csmd1Q923L3 Pradc1-204ENSMUST00000126805 953 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Csmd1Q923L3 Gm17070-201ENSMUST00000170463 784 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Csmd1Q923L3 4732414G09Rik-202ENSMUST00000180695 408 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Csmd1Q923L3 H2-Bl-203ENSMUST00000183999 358 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Csmd1Q923L3 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Csmd1Q923L3 Gm18856-203ENSMUST00000222015 483 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Csmd1Q923L3 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Csmd1Q923L3 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Csmd1Q923L3 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Csmd1Q923L3 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Csmd1Q923L3 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Csmd1Q923L3 n-R5s64-201ENSMUST00000102019 119 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Csmd1Q923L3 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Csmd1Q923L3 Gm15764-201ENSMUST00000150389 672 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Csmd1Q923L3 Uckl1os-207ENSMUST00000152365 442 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Csmd1Q923L3 Gm17214-201ENSMUST00000164501 541 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Csmd1Q923L3 Eef1b2-209ENSMUST00000188524 681 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Csmd1Q923L3 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Csmd1Q923L3 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Csmd1Q923L3 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Csmd1Q923L3 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Csmd1Q923L3 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Csmd1Q923L3 CT009489.1-201ENSMUST00000227740 1893 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Csmd1Q923L3 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Csmd1Q923L3 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Csmd1Q923L3 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Csmd1Q923L3 Cisd3-203ENSMUST00000107585 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Csmd1Q923L3 Rpl10-ps1-201ENSMUST00000119438 645 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Csmd1Q923L3 1700021J08Rik-201ENSMUST00000138729 575 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Csmd1Q923L3 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Csmd1Q923L3 Nlrp5-ps-202ENSMUST00000173220 1294 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Csmd1Q923L3 Olfr755-ps1-201ENSMUST00000173568 910 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Csmd1Q923L3 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Csmd1Q923L3 Gm27241-202ENSMUST00000185013 570 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Csmd1Q923L3 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Csmd1Q923L3 Cdipt-202ENSMUST00000205830 805 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Csmd1Q923L3 Gm5599-201ENSMUST00000209602 788 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Csmd1Q923L3 Gm45592-201ENSMUST00000209605 1043 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Csmd1Q923L3 9430078K24Rik-201ENSMUST00000218818 1082 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Csmd1Q923L3 AC154572.1-201ENSMUST00000226098 1204 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Csmd1Q923L3 1810013D15Rik-201ENSMUST00000029827 300 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Csmd1Q923L3 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Csmd1Q923L3 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Csmd1Q923L3 Gm8050-201ENSMUST00000171987 1595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Csmd1Q923L3 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Csmd1Q923L3 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Csmd1Q923L3 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Csmd1Q923L3 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Csmd1Q923L3 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Csmd1Q923L3 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms