Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4P8

Hecw1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, mousemouse

Predictions only

Length 1,604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hecw1Q8K4P8 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hecw1Q8K4P8 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hecw1Q8K4P8 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hecw1Q8K4P8 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hecw1Q8K4P8 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hecw1Q8K4P8 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hecw1Q8K4P8 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hecw1Q8K4P8 Gm10479-201ENSMUST00000101568 318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hecw1Q8K4P8 Krtap4-9-201ENSMUST00000105059 1059 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hecw1Q8K4P8 Rhox3d-ps-201ENSMUST00000119181 825 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Hecw1Q8K4P8 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hecw1Q8K4P8 Gad1-207ENSMUST00000148210 1021 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hecw1Q8K4P8 Spdye4a-202ENSMUST00000160502 1245 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hecw1Q8K4P8 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hecw1Q8K4P8 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hecw1Q8K4P8 Olfr584-201ENSMUST00000098210 964 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Hecw1Q8K4P8 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hecw1Q8K4P8 Dmrtc1b-203ENSMUST00000118842 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hecw1Q8K4P8 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hecw1Q8K4P8 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hecw1Q8K4P8 Gm11470-201ENSMUST00000118868 1475 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Hecw1Q8K4P8 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hecw1Q8K4P8 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hecw1Q8K4P8 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hecw1Q8K4P8 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hecw1Q8K4P8 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hecw1Q8K4P8 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hecw1Q8K4P8 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hecw1Q8K4P8 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hecw1Q8K4P8 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hecw1Q8K4P8 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hecw1Q8K4P8 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hecw1Q8K4P8 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hecw1Q8K4P8 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hecw1Q8K4P8 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hecw1Q8K4P8 Gm15726-201ENSMUST00000144738 509 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hecw1Q8K4P8 Nr5a1os-201ENSMUST00000146954 926 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hecw1Q8K4P8 Gm16237-201ENSMUST00000156666 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hecw1Q8K4P8 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hecw1Q8K4P8 Tbc1d22bos-202ENSMUST00000163069 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hecw1Q8K4P8 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hecw1Q8K4P8 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hecw1Q8K4P8 Gm43778-201ENSMUST00000199438 199 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Hecw1Q8K4P8 Gm18706-201ENSMUST00000210053 1066 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Hecw1Q8K4P8 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hecw1Q8K4P8 AC168279.1-201ENSMUST00000214611 382 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Hecw1Q8K4P8 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hecw1Q8K4P8 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hecw1Q8K4P8 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hecw1Q8K4P8 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hecw1Q8K4P8 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hecw1Q8K4P8 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hecw1Q8K4P8 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hecw1Q8K4P8 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hecw1Q8K4P8 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hecw1Q8K4P8 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hecw1Q8K4P8 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hecw1Q8K4P8 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hecw1Q8K4P8 2810403D21Rik-208ENSMUST00000153212 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hecw1Q8K4P8 1700007P06Rik-201ENSMUST00000160380 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hecw1Q8K4P8 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Hecw1Q8K4P8 Gm7271-202ENSMUST00000191515 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hecw1Q8K4P8 Gm7596-202ENSMUST00000202171 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hecw1Q8K4P8 Gng8-202ENSMUST00000205459 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hecw1Q8K4P8 Gm18968-201ENSMUST00000221319 862 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Hecw1Q8K4P8 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hecw1Q8K4P8 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hecw1Q8K4P8 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hecw1Q8K4P8 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Hecw1Q8K4P8 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hecw1Q8K4P8 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hecw1Q8K4P8 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hecw1Q8K4P8 AC122018.1-201ENSMUST00000217769 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hecw1Q8K4P8 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hecw1Q8K4P8 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hecw1Q8K4P8 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hecw1Q8K4P8 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hecw1Q8K4P8 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hecw1Q8K4P8 Ndufaf1-203ENSMUST00000110802 1308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hecw1Q8K4P8 Gm45576-201ENSMUST00000210981 1322 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hecw1Q8K4P8 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hecw1Q8K4P8 Gtf2h5-202ENSMUST00000100955 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hecw1Q8K4P8 Gm13022-201ENSMUST00000121181 285 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Hecw1Q8K4P8 1810021B22Rik-201ENSMUST00000150364 652 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hecw1Q8K4P8 D5Ertd615e-203ENSMUST00000198493 1032 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hecw1Q8K4P8 Stt3a-209ENSMUST00000217599 285 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hecw1Q8K4P8 Pbld1-204ENSMUST00000219045 602 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hecw1Q8K4P8 Taar9-201ENSMUST00000041180 1047 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hecw1Q8K4P8 Gm23680-201ENSMUST00000083162 164 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Hecw1Q8K4P8 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hecw1Q8K4P8 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hecw1Q8K4P8 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hecw1Q8K4P8 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hecw1Q8K4P8 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hecw1Q8K4P8 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hecw1Q8K4P8 Anxa9-204ENSMUST00000164406 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hecw1Q8K4P8 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hecw1Q8K4P8 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Hecw1Q8K4P8 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hecw1Q8K4P8 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.1 ms