Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3K8

Optn, Optineurin, mousemouse

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Length 584 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OptnQ8K3K8 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
OptnQ8K3K8 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
OptnQ8K3K8 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
OptnQ8K3K8 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
OptnQ8K3K8 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
OptnQ8K3K8 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
OptnQ8K3K8 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
OptnQ8K3K8 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
OptnQ8K3K8 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
OptnQ8K3K8 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
OptnQ8K3K8 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
OptnQ8K3K8 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
OptnQ8K3K8 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
OptnQ8K3K8 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
OptnQ8K3K8 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
OptnQ8K3K8 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
OptnQ8K3K8 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
OptnQ8K3K8 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
OptnQ8K3K8 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
OptnQ8K3K8 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
OptnQ8K3K8 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
OptnQ8K3K8 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
OptnQ8K3K8 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
OptnQ8K3K8 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
OptnQ8K3K8 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
OptnQ8K3K8 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
OptnQ8K3K8 4930430O22Rik-202ENSMUST00000202548 579 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
OptnQ8K3K8 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
OptnQ8K3K8 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
OptnQ8K3K8 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
OptnQ8K3K8 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
OptnQ8K3K8 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
OptnQ8K3K8 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
OptnQ8K3K8 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
OptnQ8K3K8 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
OptnQ8K3K8 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
OptnQ8K3K8 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
OptnQ8K3K8 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
OptnQ8K3K8 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
OptnQ8K3K8 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
OptnQ8K3K8 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
OptnQ8K3K8 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
OptnQ8K3K8 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
OptnQ8K3K8 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
OptnQ8K3K8 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
OptnQ8K3K8 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
OptnQ8K3K8 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
OptnQ8K3K8 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
OptnQ8K3K8 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
OptnQ8K3K8 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
OptnQ8K3K8 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
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OptnQ8K3K8 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
OptnQ8K3K8 Eif5a-206ENSMUST00000108609 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
OptnQ8K3K8 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
OptnQ8K3K8 Rpsa-ps4-201ENSMUST00000121691 888 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
OptnQ8K3K8 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
OptnQ8K3K8 Gm8194-201ENSMUST00000159783 859 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
OptnQ8K3K8 4930447N08Rik-203ENSMUST00000198879 1157 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
OptnQ8K3K8 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
OptnQ8K3K8 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
OptnQ8K3K8 Prm3-201ENSMUST00000050864 410 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
OptnQ8K3K8 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
OptnQ8K3K8 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
OptnQ8K3K8 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
OptnQ8K3K8 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
OptnQ8K3K8 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
OptnQ8K3K8 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
OptnQ8K3K8 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
OptnQ8K3K8 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
OptnQ8K3K8 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
OptnQ8K3K8 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
OptnQ8K3K8 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
OptnQ8K3K8 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
OptnQ8K3K8 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
OptnQ8K3K8 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
OptnQ8K3K8 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
OptnQ8K3K8 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
OptnQ8K3K8 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
OptnQ8K3K8 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
OptnQ8K3K8 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
OptnQ8K3K8 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
OptnQ8K3K8 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
OptnQ8K3K8 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
OptnQ8K3K8 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
OptnQ8K3K8 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
OptnQ8K3K8 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
OptnQ8K3K8 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
OptnQ8K3K8 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
OptnQ8K3K8 Tspo2-205ENSMUST00000162481 473 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
OptnQ8K3K8 Gm5778-201ENSMUST00000171003 1072 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
OptnQ8K3K8 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
OptnQ8K3K8 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
OptnQ8K3K8 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
OptnQ8K3K8 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
OptnQ8K3K8 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
OptnQ8K3K8 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
OptnQ8K3K8 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
OptnQ8K3K8 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
OptnQ8K3K8 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms