Protein–RNA interactions for Protein: Q8K377

Lrrtm1, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 1, mousemouse

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Length 522 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm1Q8K377 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Lrrtm1Q8K377 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Lrrtm1Q8K377 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Lrrtm1Q8K377 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Lrrtm1Q8K377 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Lrrtm1Q8K377 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Lrrtm1Q8K377 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Lrrtm1Q8K377 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Lrrtm1Q8K377 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Lrrtm1Q8K377 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Lrrtm1Q8K377 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Lrrtm1Q8K377 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Lrrtm1Q8K377 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Lrrtm1Q8K377 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Lrrtm1Q8K377 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Lrrtm1Q8K377 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Lrrtm1Q8K377 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Lrrtm1Q8K377 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Lrrtm1Q8K377 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Lrrtm1Q8K377 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Lrrtm1Q8K377 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Lrrtm1Q8K377 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Lrrtm1Q8K377 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Lrrtm1Q8K377 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Lrrtm1Q8K377 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Lrrtm1Q8K377 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Lrrtm1Q8K377 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Lrrtm1Q8K377 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Lrrtm1Q8K377 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Lrrtm1Q8K377 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Lrrtm1Q8K377 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Lrrtm1Q8K377 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Lrrtm1Q8K377 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Lrrtm1Q8K377 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Lrrtm1Q8K377 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Lrrtm1Q8K377 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Lrrtm1Q8K377 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Lrrtm1Q8K377 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Lrrtm1Q8K377 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Lrrtm1Q8K377 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Lrrtm1Q8K377 Zfp398-201ENSMUST00000079881 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Lrrtm1Q8K377 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Lrrtm1Q8K377 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Lrrtm1Q8K377 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Lrrtm1Q8K377 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Lrrtm1Q8K377 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Lrrtm1Q8K377 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Lrrtm1Q8K377 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Lrrtm1Q8K377 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Lrrtm1Q8K377 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Lrrtm1Q8K377 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Lrrtm1Q8K377 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Lrrtm1Q8K377 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Lrrtm1Q8K377 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Lrrtm1Q8K377 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
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Lrrtm1Q8K377 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Lrrtm1Q8K377 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Lrrtm1Q8K377 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Lrrtm1Q8K377 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Lrrtm1Q8K377 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
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Lrrtm1Q8K377 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
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Lrrtm1Q8K377 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
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Lrrtm1Q8K377 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
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Lrrtm1Q8K377 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Lrrtm1Q8K377 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Lrrtm1Q8K377 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Lrrtm1Q8K377 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Lrrtm1Q8K377 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Lrrtm1Q8K377 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Lrrtm1Q8K377 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Lrrtm1Q8K377 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Lrrtm1Q8K377 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Lrrtm1Q8K377 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Lrrtm1Q8K377 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Lrrtm1Q8K377 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Lrrtm1Q8K377 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Lrrtm1Q8K377 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Lrrtm1Q8K377 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Lrrtm1Q8K377 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Lrrtm1Q8K377 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Lrrtm1Q8K377 Gm15991-202ENSMUST00000212123 3565 ntBASIC10.71□□□□□ -0.7
Lrrtm1Q8K377 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Lrrtm1Q8K377 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Lrrtm1Q8K377 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Lrrtm1Q8K377 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Lrrtm1Q8K377 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Lrrtm1Q8K377 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Lrrtm1Q8K377 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Lrrtm1Q8K377 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Lrrtm1Q8K377 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Lrrtm1Q8K377 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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