Protein–RNA interactions for Protein: Q8K119

Pms1, PMS1 homolog 1, mismatch repair system component, mousemouse

Predictions only

Length 917 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pms1Q8K119 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pms1Q8K119 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pms1Q8K119 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pms1Q8K119 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pms1Q8K119 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pms1Q8K119 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pms1Q8K119 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pms1Q8K119 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pms1Q8K119 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pms1Q8K119 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pms1Q8K119 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pms1Q8K119 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pms1Q8K119 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pms1Q8K119 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pms1Q8K119 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pms1Q8K119 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pms1Q8K119 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pms1Q8K119 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pms1Q8K119 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pms1Q8K119 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pms1Q8K119 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pms1Q8K119 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Pms1Q8K119 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pms1Q8K119 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Pms1Q8K119 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pms1Q8K119 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pms1Q8K119 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pms1Q8K119 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pms1Q8K119 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pms1Q8K119 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pms1Q8K119 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pms1Q8K119 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pms1Q8K119 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pms1Q8K119 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pms1Q8K119 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pms1Q8K119 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pms1Q8K119 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pms1Q8K119 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pms1Q8K119 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pms1Q8K119 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pms1Q8K119 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pms1Q8K119 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pms1Q8K119 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pms1Q8K119 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pms1Q8K119 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pms1Q8K119 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Pms1Q8K119 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pms1Q8K119 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pms1Q8K119 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pms1Q8K119 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pms1Q8K119 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pms1Q8K119 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pms1Q8K119 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pms1Q8K119 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pms1Q8K119 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pms1Q8K119 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pms1Q8K119 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pms1Q8K119 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pms1Q8K119 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pms1Q8K119 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pms1Q8K119 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pms1Q8K119 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pms1Q8K119 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pms1Q8K119 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Pms1Q8K119 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Pms1Q8K119 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pms1Q8K119 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pms1Q8K119 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Pms1Q8K119 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pms1Q8K119 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pms1Q8K119 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pms1Q8K119 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pms1Q8K119 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pms1Q8K119 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pms1Q8K119 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pms1Q8K119 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pms1Q8K119 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pms1Q8K119 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pms1Q8K119 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pms1Q8K119 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pms1Q8K119 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pms1Q8K119 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pms1Q8K119 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pms1Q8K119 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pms1Q8K119 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pms1Q8K119 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pms1Q8K119 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pms1Q8K119 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pms1Q8K119 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pms1Q8K119 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pms1Q8K119 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pms1Q8K119 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pms1Q8K119 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Pms1Q8K119 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Pms1Q8K119 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pms1Q8K119 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pms1Q8K119 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pms1Q8K119 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pms1Q8K119 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pms1Q8K119 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.3 ms