Protein–RNA interactions for Protein: Q8K099

Lrit1, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrit1Q8K099 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrit1Q8K099 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrit1Q8K099 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrit1Q8K099 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrit1Q8K099 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrit1Q8K099 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrit1Q8K099 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrit1Q8K099 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrit1Q8K099 Gm25766-201ENSMUST00000104101 131 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrit1Q8K099 Gm12419-201ENSMUST00000116649 636 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrit1Q8K099 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrit1Q8K099 Rbm3os-201ENSMUST00000124018 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrit1Q8K099 Smim20-201ENSMUST00000147148 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrit1Q8K099 Zfp667-204ENSMUST00000153840 596 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrit1Q8K099 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrit1Q8K099 Gm26134-201ENSMUST00000178484 110 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrit1Q8K099 Gm9135-201ENSMUST00000182963 990 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrit1Q8K099 Dydc1-203ENSMUST00000189865 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrit1Q8K099 Gm35549-202ENSMUST00000203656 1009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrit1Q8K099 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrit1Q8K099 Taar8b-201ENSMUST00000092654 1035 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrit1Q8K099 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrit1Q8K099 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrit1Q8K099 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrit1Q8K099 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrit1Q8K099 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrit1Q8K099 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrit1Q8K099 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrit1Q8K099 AC166836.1-201ENSMUST00000219933 1795 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrit1Q8K099 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrit1Q8K099 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrit1Q8K099 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrit1Q8K099 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrit1Q8K099 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrit1Q8K099 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrit1Q8K099 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrit1Q8K099 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrit1Q8K099 Srd5a3-202ENSMUST00000113506 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrit1Q8K099 Atp6v1g2-202ENSMUST00000118384 483 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrit1Q8K099 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrit1Q8K099 Gm15985-201ENSMUST00000137731 343 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrit1Q8K099 Gm13558-201ENSMUST00000140464 554 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrit1Q8K099 1700122E12Rik-202ENSMUST00000147538 479 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrit1Q8K099 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrit1Q8K099 Ccl19-ps3-201ENSMUST00000179634 324 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrit1Q8K099 Gm12407-201ENSMUST00000180219 324 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrit1Q8K099 Gm8342-201ENSMUST00000209839 757 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrit1Q8K099 Sapcd1-201ENSMUST00000040151 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrit1Q8K099 Myf6-201ENSMUST00000044210 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrit1Q8K099 Uba52-201ENSMUST00000081940 541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrit1Q8K099 n-R5s185-201ENSMUST00000083953 119 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrit1Q8K099 Lta-201ENSMUST00000025266 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrit1Q8K099 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrit1Q8K099 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrit1Q8K099 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrit1Q8K099 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrit1Q8K099 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrit1Q8K099 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrit1Q8K099 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrit1Q8K099 Dmrtc1b-203ENSMUST00000118842 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrit1Q8K099 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrit1Q8K099 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrit1Q8K099 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrit1Q8K099 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrit1Q8K099 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrit1Q8K099 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrit1Q8K099 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrit1Q8K099 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrit1Q8K099 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrit1Q8K099 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrit1Q8K099 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrit1Q8K099 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrit1Q8K099 1700001C02Rik-202ENSMUST00000114743 729 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrit1Q8K099 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrit1Q8K099 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrit1Q8K099 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrit1Q8K099 Gm22146-201ENSMUST00000157397 288 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrit1Q8K099 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrit1Q8K099 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrit1Q8K099 Cabcoco1-201ENSMUST00000020103 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrit1Q8K099 Stt3a-209ENSMUST00000217599 285 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrit1Q8K099 Gm18514-201ENSMUST00000218980 436 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrit1Q8K099 AC113282.2-201ENSMUST00000224012 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrit1Q8K099 AC113282.3-201ENSMUST00000224757 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrit1Q8K099 Lgi3-203ENSMUST00000226548 1001 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrit1Q8K099 Ccdc28b-201ENSMUST00000030586 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrit1Q8K099 Prss55-201ENSMUST00000089338 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrit1Q8K099 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrit1Q8K099 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrit1Q8K099 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrit1Q8K099 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrit1Q8K099 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrit1Q8K099 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrit1Q8K099 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrit1Q8K099 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrit1Q8K099 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrit1Q8K099 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrit1Q8K099 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrit1Q8K099 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrit1Q8K099 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms