Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFE2

Hpf1, Histone PARylation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hpf1Q8CFE2 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Hpf1Q8CFE2 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hpf1Q8CFE2 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hpf1Q8CFE2 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hpf1Q8CFE2 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hpf1Q8CFE2 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hpf1Q8CFE2 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hpf1Q8CFE2 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hpf1Q8CFE2 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Hpf1Q8CFE2 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hpf1Q8CFE2 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hpf1Q8CFE2 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Hpf1Q8CFE2 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Hpf1Q8CFE2 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hpf1Q8CFE2 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hpf1Q8CFE2 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hpf1Q8CFE2 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hpf1Q8CFE2 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hpf1Q8CFE2 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hpf1Q8CFE2 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hpf1Q8CFE2 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Hpf1Q8CFE2 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hpf1Q8CFE2 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hpf1Q8CFE2 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hpf1Q8CFE2 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hpf1Q8CFE2 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hpf1Q8CFE2 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hpf1Q8CFE2 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hpf1Q8CFE2 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hpf1Q8CFE2 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hpf1Q8CFE2 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hpf1Q8CFE2 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hpf1Q8CFE2 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hpf1Q8CFE2 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hpf1Q8CFE2 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hpf1Q8CFE2 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hpf1Q8CFE2 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hpf1Q8CFE2 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hpf1Q8CFE2 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hpf1Q8CFE2 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hpf1Q8CFE2 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Hpf1Q8CFE2 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hpf1Q8CFE2 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hpf1Q8CFE2 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hpf1Q8CFE2 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hpf1Q8CFE2 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Hpf1Q8CFE2 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Hpf1Q8CFE2 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Hpf1Q8CFE2 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Hpf1Q8CFE2 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Hpf1Q8CFE2 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Hpf1Q8CFE2 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Hpf1Q8CFE2 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Hpf1Q8CFE2 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Hpf1Q8CFE2 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Hpf1Q8CFE2 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Hpf1Q8CFE2 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Hpf1Q8CFE2 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Hpf1Q8CFE2 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Hpf1Q8CFE2 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Hpf1Q8CFE2 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Hpf1Q8CFE2 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Hpf1Q8CFE2 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Hpf1Q8CFE2 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Hpf1Q8CFE2 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Hpf1Q8CFE2 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Hpf1Q8CFE2 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Hpf1Q8CFE2 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Hpf1Q8CFE2 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Hpf1Q8CFE2 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Hpf1Q8CFE2 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Hpf1Q8CFE2 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Hpf1Q8CFE2 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Hpf1Q8CFE2 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Hpf1Q8CFE2 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Hpf1Q8CFE2 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Hpf1Q8CFE2 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Hpf1Q8CFE2 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Hpf1Q8CFE2 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Hpf1Q8CFE2 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Hpf1Q8CFE2 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Hpf1Q8CFE2 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Hpf1Q8CFE2 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Hpf1Q8CFE2 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Hpf1Q8CFE2 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Hpf1Q8CFE2 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Hpf1Q8CFE2 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Hpf1Q8CFE2 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Hpf1Q8CFE2 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Hpf1Q8CFE2 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Hpf1Q8CFE2 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Hpf1Q8CFE2 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Hpf1Q8CFE2 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Hpf1Q8CFE2 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Hpf1Q8CFE2 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Hpf1Q8CFE2 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Hpf1Q8CFE2 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Hpf1Q8CFE2 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Hpf1Q8CFE2 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Hpf1Q8CFE2 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms