Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEQ0

Cdkl1, Cyclin-dependent kinase-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl1Q8CEQ0 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cdkl1Q8CEQ0 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cdkl1Q8CEQ0 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cdkl1Q8CEQ0 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cdkl1Q8CEQ0 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cdkl1Q8CEQ0 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cdkl1Q8CEQ0 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cdkl1Q8CEQ0 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cdkl1Q8CEQ0 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cdkl1Q8CEQ0 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cdkl1Q8CEQ0 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cdkl1Q8CEQ0 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cdkl1Q8CEQ0 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cdkl1Q8CEQ0 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cdkl1Q8CEQ0 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cdkl1Q8CEQ0 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cdkl1Q8CEQ0 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cdkl1Q8CEQ0 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cdkl1Q8CEQ0 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cdkl1Q8CEQ0 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cdkl1Q8CEQ0 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cdkl1Q8CEQ0 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cdkl1Q8CEQ0 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cdkl1Q8CEQ0 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cdkl1Q8CEQ0 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cdkl1Q8CEQ0 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cdkl1Q8CEQ0 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cdkl1Q8CEQ0 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cdkl1Q8CEQ0 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Cdkl1Q8CEQ0 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cdkl1Q8CEQ0 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Cdkl1Q8CEQ0 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cdkl1Q8CEQ0 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Cdkl1Q8CEQ0 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cdkl1Q8CEQ0 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cdkl1Q8CEQ0 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cdkl1Q8CEQ0 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cdkl1Q8CEQ0 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cdkl1Q8CEQ0 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Cdkl1Q8CEQ0 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cdkl1Q8CEQ0 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cdkl1Q8CEQ0 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cdkl1Q8CEQ0 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cdkl1Q8CEQ0 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cdkl1Q8CEQ0 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cdkl1Q8CEQ0 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cdkl1Q8CEQ0 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cdkl1Q8CEQ0 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cdkl1Q8CEQ0 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cdkl1Q8CEQ0 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cdkl1Q8CEQ0 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cdkl1Q8CEQ0 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cdkl1Q8CEQ0 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cdkl1Q8CEQ0 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cdkl1Q8CEQ0 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cdkl1Q8CEQ0 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cdkl1Q8CEQ0 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cdkl1Q8CEQ0 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cdkl1Q8CEQ0 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cdkl1Q8CEQ0 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cdkl1Q8CEQ0 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cdkl1Q8CEQ0 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cdkl1Q8CEQ0 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cdkl1Q8CEQ0 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cdkl1Q8CEQ0 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cdkl1Q8CEQ0 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cdkl1Q8CEQ0 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cdkl1Q8CEQ0 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cdkl1Q8CEQ0 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cdkl1Q8CEQ0 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Cdkl1Q8CEQ0 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cdkl1Q8CEQ0 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Cdkl1Q8CEQ0 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cdkl1Q8CEQ0 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cdkl1Q8CEQ0 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cdkl1Q8CEQ0 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Cdkl1Q8CEQ0 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cdkl1Q8CEQ0 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cdkl1Q8CEQ0 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cdkl1Q8CEQ0 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cdkl1Q8CEQ0 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cdkl1Q8CEQ0 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cdkl1Q8CEQ0 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cdkl1Q8CEQ0 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cdkl1Q8CEQ0 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cdkl1Q8CEQ0 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cdkl1Q8CEQ0 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cdkl1Q8CEQ0 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cdkl1Q8CEQ0 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cdkl1Q8CEQ0 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cdkl1Q8CEQ0 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cdkl1Q8CEQ0 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cdkl1Q8CEQ0 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cdkl1Q8CEQ0 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Cdkl1Q8CEQ0 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.51
Cdkl1Q8CEQ0 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Cdkl1Q8CEQ0 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms