Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEC0

Nup88, Nuclear pore complex protein Nup88, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 753 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup88Q8CEC0 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nup88Q8CEC0 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nup88Q8CEC0 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nup88Q8CEC0 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nup88Q8CEC0 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nup88Q8CEC0 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nup88Q8CEC0 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nup88Q8CEC0 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nup88Q8CEC0 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nup88Q8CEC0 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nup88Q8CEC0 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nup88Q8CEC0 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nup88Q8CEC0 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nup88Q8CEC0 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Nup88Q8CEC0 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nup88Q8CEC0 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nup88Q8CEC0 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nup88Q8CEC0 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nup88Q8CEC0 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nup88Q8CEC0 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nup88Q8CEC0 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nup88Q8CEC0 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Nup88Q8CEC0 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nup88Q8CEC0 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Nup88Q8CEC0 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Nup88Q8CEC0 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nup88Q8CEC0 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Nup88Q8CEC0 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Nup88Q8CEC0 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nup88Q8CEC0 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nup88Q8CEC0 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Nup88Q8CEC0 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Nup88Q8CEC0 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nup88Q8CEC0 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nup88Q8CEC0 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nup88Q8CEC0 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nup88Q8CEC0 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nup88Q8CEC0 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nup88Q8CEC0 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nup88Q8CEC0 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nup88Q8CEC0 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nup88Q8CEC0 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Nup88Q8CEC0 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nup88Q8CEC0 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nup88Q8CEC0 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nup88Q8CEC0 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nup88Q8CEC0 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nup88Q8CEC0 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nup88Q8CEC0 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nup88Q8CEC0 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nup88Q8CEC0 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nup88Q8CEC0 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nup88Q8CEC0 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nup88Q8CEC0 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nup88Q8CEC0 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nup88Q8CEC0 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nup88Q8CEC0 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nup88Q8CEC0 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Nup88Q8CEC0 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nup88Q8CEC0 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Nup88Q8CEC0 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Nup88Q8CEC0 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nup88Q8CEC0 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nup88Q8CEC0 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Nup88Q8CEC0 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nup88Q8CEC0 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nup88Q8CEC0 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Nup88Q8CEC0 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nup88Q8CEC0 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nup88Q8CEC0 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nup88Q8CEC0 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nup88Q8CEC0 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nup88Q8CEC0 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Nup88Q8CEC0 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nup88Q8CEC0 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nup88Q8CEC0 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nup88Q8CEC0 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nup88Q8CEC0 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nup88Q8CEC0 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nup88Q8CEC0 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nup88Q8CEC0 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nup88Q8CEC0 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Nup88Q8CEC0 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nup88Q8CEC0 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nup88Q8CEC0 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nup88Q8CEC0 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nup88Q8CEC0 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nup88Q8CEC0 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nup88Q8CEC0 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nup88Q8CEC0 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nup88Q8CEC0 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nup88Q8CEC0 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nup88Q8CEC0 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Nup88Q8CEC0 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nup88Q8CEC0 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nup88Q8CEC0 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nup88Q8CEC0 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nup88Q8CEC0 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nup88Q8CEC0 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nup88Q8CEC0 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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