Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDM1

Atad2, ATPase family AAA domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,040 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atad2Q8CDM1 Gm45554-202ENSMUST00000210964 1090 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atad2Q8CDM1 4930407I19Rik-201ENSMUST00000220265 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atad2Q8CDM1 Vmn1r16-201ENSMUST00000227168 912 ntAPPRIS P2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atad2Q8CDM1 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atad2Q8CDM1 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atad2Q8CDM1 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atad2Q8CDM1 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atad2Q8CDM1 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atad2Q8CDM1 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atad2Q8CDM1 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atad2Q8CDM1 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atad2Q8CDM1 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atad2Q8CDM1 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atad2Q8CDM1 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atad2Q8CDM1 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Atad2Q8CDM1 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atad2Q8CDM1 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atad2Q8CDM1 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atad2Q8CDM1 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atad2Q8CDM1 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atad2Q8CDM1 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atad2Q8CDM1 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Atad2Q8CDM1 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Atad2Q8CDM1 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Atad2Q8CDM1 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Atad2Q8CDM1 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Atad2Q8CDM1 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Atad2Q8CDM1 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atad2Q8CDM1 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atad2Q8CDM1 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atad2Q8CDM1 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Atad2Q8CDM1 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Atad2Q8CDM1 Gm28585-201ENSMUST00000187587 442 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Atad2Q8CDM1 Gm28926-201ENSMUST00000191063 680 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Atad2Q8CDM1 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atad2Q8CDM1 Gm44681-201ENSMUST00000208447 842 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Atad2Q8CDM1 Lilrb4a-205ENSMUST00000217705 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atad2Q8CDM1 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atad2Q8CDM1 Gm20063-201ENSMUST00000220757 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atad2Q8CDM1 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Atad2Q8CDM1 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atad2Q8CDM1 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Atad2Q8CDM1 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atad2Q8CDM1 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Atad2Q8CDM1 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atad2Q8CDM1 Gm10419-201ENSMUST00000100944 1671 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Atad2Q8CDM1 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atad2Q8CDM1 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Atad2Q8CDM1 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Atad2Q8CDM1 Olfr1288-202ENSMUST00000214816 1326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Atad2Q8CDM1 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Atad2Q8CDM1 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atad2Q8CDM1 Gm19210-201ENSMUST00000199562 1350 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Atad2Q8CDM1 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Atad2Q8CDM1 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atad2Q8CDM1 Gm18300-201ENSMUST00000192792 1406 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Atad2Q8CDM1 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atad2Q8CDM1 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atad2Q8CDM1 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atad2Q8CDM1 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atad2Q8CDM1 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atad2Q8CDM1 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atad2Q8CDM1 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Atad2Q8CDM1 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atad2Q8CDM1 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atad2Q8CDM1 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atad2Q8CDM1 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Atad2Q8CDM1 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Atad2Q8CDM1 Gm15529-201ENSMUST00000121833 994 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Atad2Q8CDM1 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atad2Q8CDM1 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Atad2Q8CDM1 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Atad2Q8CDM1 4930458B22Rik-201ENSMUST00000209339 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atad2Q8CDM1 Pdcl2-201ENSMUST00000031145 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atad2Q8CDM1 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Atad2Q8CDM1 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Atad2Q8CDM1 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atad2Q8CDM1 Gm9575-201ENSMUST00000122140 1339 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Atad2Q8CDM1 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Atad2Q8CDM1 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atad2Q8CDM1 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atad2Q8CDM1 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Atad2Q8CDM1 Gm43149-201ENSMUST00000198162 1422 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Atad2Q8CDM1 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atad2Q8CDM1 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atad2Q8CDM1 Gm42975-201ENSMUST00000200612 1491 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Atad2Q8CDM1 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atad2Q8CDM1 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atad2Q8CDM1 Ctdspl2-203ENSMUST00000110574 1616 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Atad2Q8CDM1 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Atad2Q8CDM1 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atad2Q8CDM1 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Atad2Q8CDM1 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Atad2Q8CDM1 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Atad2Q8CDM1 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atad2Q8CDM1 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atad2Q8CDM1 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atad2Q8CDM1 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atad2Q8CDM1 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Atad2Q8CDM1 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.3 ms