Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBA2

Slfn5, Schlafen family member 5, mousemouse

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Length 884 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfn5Q8CBA2 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Slfn5Q8CBA2 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Slfn5Q8CBA2 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Slfn5Q8CBA2 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Slfn5Q8CBA2 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Slfn5Q8CBA2 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Slfn5Q8CBA2 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Slfn5Q8CBA2 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Slfn5Q8CBA2 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Slfn5Q8CBA2 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Slfn5Q8CBA2 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Slfn5Q8CBA2 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Slfn5Q8CBA2 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Slfn5Q8CBA2 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Slfn5Q8CBA2 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Slfn5Q8CBA2 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Slfn5Q8CBA2 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Slfn5Q8CBA2 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Slfn5Q8CBA2 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Slfn5Q8CBA2 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Slfn5Q8CBA2 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Slfn5Q8CBA2 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Slfn5Q8CBA2 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Slfn5Q8CBA2 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Slfn5Q8CBA2 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Slfn5Q8CBA2 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Slfn5Q8CBA2 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Slfn5Q8CBA2 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Slfn5Q8CBA2 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Slfn5Q8CBA2 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Slfn5Q8CBA2 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Slfn5Q8CBA2 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Slfn5Q8CBA2 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Slfn5Q8CBA2 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Slfn5Q8CBA2 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Slfn5Q8CBA2 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Slfn5Q8CBA2 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Slfn5Q8CBA2 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Slfn5Q8CBA2 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Slfn5Q8CBA2 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Slfn5Q8CBA2 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Slfn5Q8CBA2 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Slfn5Q8CBA2 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Slfn5Q8CBA2 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Slfn5Q8CBA2 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Slfn5Q8CBA2 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Slfn5Q8CBA2 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Slfn5Q8CBA2 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Slfn5Q8CBA2 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Slfn5Q8CBA2 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Slfn5Q8CBA2 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Slfn5Q8CBA2 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Slfn5Q8CBA2 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Slfn5Q8CBA2 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Slfn5Q8CBA2 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Slfn5Q8CBA2 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Slfn5Q8CBA2 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Slfn5Q8CBA2 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Slfn5Q8CBA2 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Slfn5Q8CBA2 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Slfn5Q8CBA2 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Slfn5Q8CBA2 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Slfn5Q8CBA2 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Slfn5Q8CBA2 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Slfn5Q8CBA2 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Slfn5Q8CBA2 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Slfn5Q8CBA2 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Slfn5Q8CBA2 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Slfn5Q8CBA2 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Slfn5Q8CBA2 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Slfn5Q8CBA2 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Slfn5Q8CBA2 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Slfn5Q8CBA2 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Slfn5Q8CBA2 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Slfn5Q8CBA2 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Slfn5Q8CBA2 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Slfn5Q8CBA2 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Slfn5Q8CBA2 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Slfn5Q8CBA2 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Slfn5Q8CBA2 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Slfn5Q8CBA2 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Slfn5Q8CBA2 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Slfn5Q8CBA2 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Slfn5Q8CBA2 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Slfn5Q8CBA2 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Slfn5Q8CBA2 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Slfn5Q8CBA2 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Slfn5Q8CBA2 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Slfn5Q8CBA2 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Slfn5Q8CBA2 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Slfn5Q8CBA2 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Slfn5Q8CBA2 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Slfn5Q8CBA2 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Slfn5Q8CBA2 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Slfn5Q8CBA2 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Slfn5Q8CBA2 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Slfn5Q8CBA2 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Slfn5Q8CBA2 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Slfn5Q8CBA2 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Slfn5Q8CBA2 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 286.4 ms