Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9S8

Atg4a, Cysteine protease ATG4A, mousemouse

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4aQ8C9S8 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Atg4aQ8C9S8 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atg4aQ8C9S8 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atg4aQ8C9S8 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Atg4aQ8C9S8 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Atg4aQ8C9S8 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atg4aQ8C9S8 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Atg4aQ8C9S8 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atg4aQ8C9S8 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atg4aQ8C9S8 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Atg4aQ8C9S8 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Atg4aQ8C9S8 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atg4aQ8C9S8 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Atg4aQ8C9S8 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Atg4aQ8C9S8 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atg4aQ8C9S8 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atg4aQ8C9S8 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Atg4aQ8C9S8 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Atg4aQ8C9S8 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Atg4aQ8C9S8 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atg4aQ8C9S8 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Atg4aQ8C9S8 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atg4aQ8C9S8 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atg4aQ8C9S8 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atg4aQ8C9S8 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atg4aQ8C9S8 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atg4aQ8C9S8 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atg4aQ8C9S8 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atg4aQ8C9S8 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atg4aQ8C9S8 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Atg4aQ8C9S8 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
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