Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5U0

4933409G03Rik, RIKEN cDNA 4933409G03 gene, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933409G03RikQ8C5U0 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
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4933409G03RikQ8C5U0 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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4933409G03RikQ8C5U0 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
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