Protein–RNA interactions for Protein: Q8C2S0

Usp44, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 44, mousemouse

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Length 711 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp44Q8C2S0 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp44Q8C2S0 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp44Q8C2S0 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp44Q8C2S0 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp44Q8C2S0 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp44Q8C2S0 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp44Q8C2S0 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp44Q8C2S0 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp44Q8C2S0 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Usp44Q8C2S0 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp44Q8C2S0 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp44Q8C2S0 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp44Q8C2S0 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Usp44Q8C2S0 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Usp44Q8C2S0 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp44Q8C2S0 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp44Q8C2S0 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp44Q8C2S0 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Usp44Q8C2S0 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Usp44Q8C2S0 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
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Usp44Q8C2S0 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Usp44Q8C2S0 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Usp44Q8C2S0 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Usp44Q8C2S0 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Usp44Q8C2S0 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Usp44Q8C2S0 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Usp44Q8C2S0 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Usp44Q8C2S0 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp44Q8C2S0 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Usp44Q8C2S0 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp44Q8C2S0 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp44Q8C2S0 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Usp44Q8C2S0 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp44Q8C2S0 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp44Q8C2S0 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Usp44Q8C2S0 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp44Q8C2S0 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Usp44Q8C2S0 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp44Q8C2S0 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp44Q8C2S0 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp44Q8C2S0 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp44Q8C2S0 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp44Q8C2S0 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp44Q8C2S0 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp44Q8C2S0 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp44Q8C2S0 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp44Q8C2S0 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp44Q8C2S0 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp44Q8C2S0 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp44Q8C2S0 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp44Q8C2S0 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Usp44Q8C2S0 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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