Protein–RNA interactions for Protein: Q8C156

Ncaph, Condensin complex subunit 2, mousemouse

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Length 731 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcaphQ8C156 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NcaphQ8C156 Fam92b-201ENSMUST00000048786 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
NcaphQ8C156 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NcaphQ8C156 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NcaphQ8C156 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NcaphQ8C156 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NcaphQ8C156 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NcaphQ8C156 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
NcaphQ8C156 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NcaphQ8C156 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NcaphQ8C156 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NcaphQ8C156 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NcaphQ8C156 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NcaphQ8C156 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
NcaphQ8C156 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
NcaphQ8C156 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NcaphQ8C156 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NcaphQ8C156 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
NcaphQ8C156 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NcaphQ8C156 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
NcaphQ8C156 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
NcaphQ8C156 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
NcaphQ8C156 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
NcaphQ8C156 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
NcaphQ8C156 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
NcaphQ8C156 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
NcaphQ8C156 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
NcaphQ8C156 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
NcaphQ8C156 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NcaphQ8C156 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
NcaphQ8C156 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NcaphQ8C156 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
NcaphQ8C156 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NcaphQ8C156 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NcaphQ8C156 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
NcaphQ8C156 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
NcaphQ8C156 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NcaphQ8C156 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NcaphQ8C156 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
NcaphQ8C156 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NcaphQ8C156 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NcaphQ8C156 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NcaphQ8C156 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
NcaphQ8C156 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NcaphQ8C156 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NcaphQ8C156 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
NcaphQ8C156 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NcaphQ8C156 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
NcaphQ8C156 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NcaphQ8C156 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NcaphQ8C156 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NcaphQ8C156 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
NcaphQ8C156 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NcaphQ8C156 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NcaphQ8C156 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NcaphQ8C156 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NcaphQ8C156 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NcaphQ8C156 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NcaphQ8C156 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NcaphQ8C156 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NcaphQ8C156 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NcaphQ8C156 Snx29-202ENSMUST00000115814 1125 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NcaphQ8C156 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
NcaphQ8C156 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NcaphQ8C156 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NcaphQ8C156 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NcaphQ8C156 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
NcaphQ8C156 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
NcaphQ8C156 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NcaphQ8C156 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NcaphQ8C156 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NcaphQ8C156 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NcaphQ8C156 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NcaphQ8C156 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NcaphQ8C156 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NcaphQ8C156 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NcaphQ8C156 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NcaphQ8C156 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NcaphQ8C156 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NcaphQ8C156 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NcaphQ8C156 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NcaphQ8C156 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NcaphQ8C156 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
NcaphQ8C156 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NcaphQ8C156 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NcaphQ8C156 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NcaphQ8C156 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NcaphQ8C156 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NcaphQ8C156 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NcaphQ8C156 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NcaphQ8C156 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NcaphQ8C156 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NcaphQ8C156 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NcaphQ8C156 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NcaphQ8C156 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
NcaphQ8C156 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
NcaphQ8C156 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
NcaphQ8C156 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
NcaphQ8C156 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
NcaphQ8C156 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
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