Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXJ2

Trerf1, Transcriptional-regulating factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trerf1Q8BXJ2 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trerf1Q8BXJ2 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trerf1Q8BXJ2 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trerf1Q8BXJ2 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trerf1Q8BXJ2 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trerf1Q8BXJ2 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trerf1Q8BXJ2 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trerf1Q8BXJ2 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trerf1Q8BXJ2 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trerf1Q8BXJ2 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trerf1Q8BXJ2 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Trerf1Q8BXJ2 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trerf1Q8BXJ2 S100pbp-203ENSMUST00000106059 4084 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trerf1Q8BXJ2 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trerf1Q8BXJ2 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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Trerf1Q8BXJ2 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trerf1Q8BXJ2 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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Trerf1Q8BXJ2 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trerf1Q8BXJ2 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trerf1Q8BXJ2 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trerf1Q8BXJ2 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
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Trerf1Q8BXJ2 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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Trerf1Q8BXJ2 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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Trerf1Q8BXJ2 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trerf1Q8BXJ2 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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Trerf1Q8BXJ2 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trerf1Q8BXJ2 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trerf1Q8BXJ2 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trerf1Q8BXJ2 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trerf1Q8BXJ2 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trerf1Q8BXJ2 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trerf1Q8BXJ2 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trerf1Q8BXJ2 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
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Trerf1Q8BXJ2 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trerf1Q8BXJ2 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trerf1Q8BXJ2 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trerf1Q8BXJ2 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trerf1Q8BXJ2 Smtn-210ENSMUST00000170588 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trerf1Q8BXJ2 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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Trerf1Q8BXJ2 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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Trerf1Q8BXJ2 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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Trerf1Q8BXJ2 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trerf1Q8BXJ2 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trerf1Q8BXJ2 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trerf1Q8BXJ2 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trerf1Q8BXJ2 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Trerf1Q8BXJ2 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trerf1Q8BXJ2 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trerf1Q8BXJ2 Aldh3a1-202ENSMUST00000108716 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trerf1Q8BXJ2 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trerf1Q8BXJ2 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trerf1Q8BXJ2 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trerf1Q8BXJ2 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trerf1Q8BXJ2 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trerf1Q8BXJ2 Srp54b-202ENSMUST00000218879 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trerf1Q8BXJ2 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trerf1Q8BXJ2 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Trerf1Q8BXJ2 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trerf1Q8BXJ2 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trerf1Q8BXJ2 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trerf1Q8BXJ2 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trerf1Q8BXJ2 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trerf1Q8BXJ2 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trerf1Q8BXJ2 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trerf1Q8BXJ2 Avpr2-202ENSMUST00000101470 2787 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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