Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW70

Usp38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, mousemouse

Predictions only

Length 1,042 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp38Q8BW70 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp38Q8BW70 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp38Q8BW70 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp38Q8BW70 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp38Q8BW70 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp38Q8BW70 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp38Q8BW70 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp38Q8BW70 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp38Q8BW70 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp38Q8BW70 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp38Q8BW70 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp38Q8BW70 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp38Q8BW70 4930506C21Rik-203ENSMUST00000130639 909 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp38Q8BW70 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp38Q8BW70 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp38Q8BW70 Mir6958-201ENSMUST00000184207 73 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
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Usp38Q8BW70 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Usp38Q8BW70 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp38Q8BW70 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp38Q8BW70 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Usp38Q8BW70 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp38Q8BW70 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp38Q8BW70 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp38Q8BW70 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp38Q8BW70 Srp19-201ENSMUST00000072576 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp38Q8BW70 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Usp38Q8BW70 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Usp38Q8BW70 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp38Q8BW70 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Usp38Q8BW70 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Usp38Q8BW70 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Usp38Q8BW70 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Usp38Q8BW70 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp38Q8BW70 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp38Q8BW70 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp38Q8BW70 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp38Q8BW70 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Usp38Q8BW70 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Usp38Q8BW70 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp38Q8BW70 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp38Q8BW70 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp38Q8BW70 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp38Q8BW70 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp38Q8BW70 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp38Q8BW70 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Usp38Q8BW70 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Usp38Q8BW70 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Usp38Q8BW70 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Usp38Q8BW70 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Usp38Q8BW70 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Usp38Q8BW70 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Usp38Q8BW70 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Usp38Q8BW70 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Usp38Q8BW70 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Usp38Q8BW70 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Usp38Q8BW70 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Usp38Q8BW70 Itpr3os-201ENSMUST00000143605 794 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Usp38Q8BW70 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Usp38Q8BW70 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Usp38Q8BW70 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.6 ms