Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVF4

Ccdc30, Coiled-coil domain-containing protein 30, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc30Q8BVF4 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc30Q8BVF4 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc30Q8BVF4 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc30Q8BVF4 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc30Q8BVF4 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc30Q8BVF4 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc30Q8BVF4 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc30Q8BVF4 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc30Q8BVF4 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc30Q8BVF4 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc30Q8BVF4 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc30Q8BVF4 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc30Q8BVF4 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc30Q8BVF4 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc30Q8BVF4 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc30Q8BVF4 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc30Q8BVF4 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc30Q8BVF4 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc30Q8BVF4 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc30Q8BVF4 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc30Q8BVF4 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc30Q8BVF4 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc30Q8BVF4 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc30Q8BVF4 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc30Q8BVF4 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc30Q8BVF4 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc30Q8BVF4 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc30Q8BVF4 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc30Q8BVF4 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc30Q8BVF4 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc30Q8BVF4 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc30Q8BVF4 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc30Q8BVF4 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc30Q8BVF4 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc30Q8BVF4 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc30Q8BVF4 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc30Q8BVF4 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc30Q8BVF4 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc30Q8BVF4 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc30Q8BVF4 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc30Q8BVF4 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc30Q8BVF4 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc30Q8BVF4 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc30Q8BVF4 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc30Q8BVF4 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc30Q8BVF4 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc30Q8BVF4 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc30Q8BVF4 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc30Q8BVF4 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc30Q8BVF4 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc30Q8BVF4 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc30Q8BVF4 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc30Q8BVF4 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc30Q8BVF4 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc30Q8BVF4 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc30Q8BVF4 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc30Q8BVF4 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc30Q8BVF4 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc30Q8BVF4 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc30Q8BVF4 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc30Q8BVF4 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc30Q8BVF4 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc30Q8BVF4 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc30Q8BVF4 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc30Q8BVF4 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc30Q8BVF4 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc30Q8BVF4 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc30Q8BVF4 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc30Q8BVF4 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc30Q8BVF4 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc30Q8BVF4 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc30Q8BVF4 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc30Q8BVF4 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc30Q8BVF4 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc30Q8BVF4 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc30Q8BVF4 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc30Q8BVF4 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc30Q8BVF4 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc30Q8BVF4 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc30Q8BVF4 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc30Q8BVF4 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc30Q8BVF4 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc30Q8BVF4 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc30Q8BVF4 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc30Q8BVF4 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc30Q8BVF4 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc30Q8BVF4 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc30Q8BVF4 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc30Q8BVF4 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc30Q8BVF4 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc30Q8BVF4 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc30Q8BVF4 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc30Q8BVF4 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc30Q8BVF4 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc30Q8BVF4 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc30Q8BVF4 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc30Q8BVF4 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc30Q8BVF4 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc30Q8BVF4 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc30Q8BVF4 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.9 ms