Protein–RNA interactions for Protein: Q8BK35

Nop53, Ribosome biogenesis protein NOP53, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop53Q8BK35 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nop53Q8BK35 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nop53Q8BK35 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nop53Q8BK35 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nop53Q8BK35 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nop53Q8BK35 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nop53Q8BK35 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nop53Q8BK35 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nop53Q8BK35 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nop53Q8BK35 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Nop53Q8BK35 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nop53Q8BK35 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nop53Q8BK35 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nop53Q8BK35 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nop53Q8BK35 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nop53Q8BK35 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Nop53Q8BK35 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Nop53Q8BK35 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nop53Q8BK35 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nop53Q8BK35 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Nop53Q8BK35 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nop53Q8BK35 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nop53Q8BK35 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nop53Q8BK35 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nop53Q8BK35 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nop53Q8BK35 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nop53Q8BK35 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nop53Q8BK35 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nop53Q8BK35 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nop53Q8BK35 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nop53Q8BK35 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nop53Q8BK35 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nop53Q8BK35 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nop53Q8BK35 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nop53Q8BK35 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nop53Q8BK35 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nop53Q8BK35 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nop53Q8BK35 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nop53Q8BK35 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nop53Q8BK35 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nop53Q8BK35 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nop53Q8BK35 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nop53Q8BK35 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nop53Q8BK35 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nop53Q8BK35 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nop53Q8BK35 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nop53Q8BK35 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nop53Q8BK35 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nop53Q8BK35 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Nop53Q8BK35 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Nop53Q8BK35 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nop53Q8BK35 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Nop53Q8BK35 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nop53Q8BK35 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nop53Q8BK35 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Nop53Q8BK35 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nop53Q8BK35 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nop53Q8BK35 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nop53Q8BK35 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nop53Q8BK35 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nop53Q8BK35 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nop53Q8BK35 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nop53Q8BK35 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nop53Q8BK35 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nop53Q8BK35 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nop53Q8BK35 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nop53Q8BK35 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nop53Q8BK35 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nop53Q8BK35 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nop53Q8BK35 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nop53Q8BK35 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nop53Q8BK35 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nop53Q8BK35 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nop53Q8BK35 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nop53Q8BK35 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nop53Q8BK35 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nop53Q8BK35 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nop53Q8BK35 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nop53Q8BK35 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nop53Q8BK35 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nop53Q8BK35 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nop53Q8BK35 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nop53Q8BK35 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nop53Q8BK35 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Nop53Q8BK35 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nop53Q8BK35 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nop53Q8BK35 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nop53Q8BK35 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nop53Q8BK35 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nop53Q8BK35 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nop53Q8BK35 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nop53Q8BK35 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nop53Q8BK35 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nop53Q8BK35 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nop53Q8BK35 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nop53Q8BK35 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nop53Q8BK35 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nop53Q8BK35 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Nop53Q8BK35 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nop53Q8BK35 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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