Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGG7

Ubash3b, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein B, mousemouse

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Length 638 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubash3bQ8BGG7 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ubash3bQ8BGG7 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ubash3bQ8BGG7 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ubash3bQ8BGG7 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ubash3bQ8BGG7 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ubash3bQ8BGG7 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ubash3bQ8BGG7 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Ubash3bQ8BGG7 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ubash3bQ8BGG7 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ubash3bQ8BGG7 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ubash3bQ8BGG7 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ubash3bQ8BGG7 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ubash3bQ8BGG7 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ubash3bQ8BGG7 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ubash3bQ8BGG7 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ubash3bQ8BGG7 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ubash3bQ8BGG7 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Ubash3bQ8BGG7 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Ubash3bQ8BGG7 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
Ubash3bQ8BGG7 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ubash3bQ8BGG7 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ubash3bQ8BGG7 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ubash3bQ8BGG7 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ubash3bQ8BGG7 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ubash3bQ8BGG7 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ubash3bQ8BGG7 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ubash3bQ8BGG7 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ubash3bQ8BGG7 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ubash3bQ8BGG7 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Ubash3bQ8BGG7 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ubash3bQ8BGG7 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ubash3bQ8BGG7 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ubash3bQ8BGG7 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Ubash3bQ8BGG7 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ubash3bQ8BGG7 Gm2594-201ENSMUST00000214774 742 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Ubash3bQ8BGG7 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ubash3bQ8BGG7 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Ubash3bQ8BGG7 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ubash3bQ8BGG7 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ubash3bQ8BGG7 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ubash3bQ8BGG7 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ubash3bQ8BGG7 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ubash3bQ8BGG7 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ubash3bQ8BGG7 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Ubash3bQ8BGG7 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ubash3bQ8BGG7 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ubash3bQ8BGG7 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ubash3bQ8BGG7 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ubash3bQ8BGG7 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ubash3bQ8BGG7 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ubash3bQ8BGG7 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ubash3bQ8BGG7 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ubash3bQ8BGG7 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Ubash3bQ8BGG7 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ubash3bQ8BGG7 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ubash3bQ8BGG7 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ubash3bQ8BGG7 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ubash3bQ8BGG7 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ubash3bQ8BGG7 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ubash3bQ8BGG7 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ubash3bQ8BGG7 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ubash3bQ8BGG7 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ubash3bQ8BGG7 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ubash3bQ8BGG7 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ubash3bQ8BGG7 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ubash3bQ8BGG7 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ubash3bQ8BGG7 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ubash3bQ8BGG7 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
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Ubash3bQ8BGG7 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ubash3bQ8BGG7 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ubash3bQ8BGG7 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ubash3bQ8BGG7 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ubash3bQ8BGG7 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ubash3bQ8BGG7 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ubash3bQ8BGG7 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ubash3bQ8BGG7 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ubash3bQ8BGG7 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Ubash3bQ8BGG7 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ubash3bQ8BGG7 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ubash3bQ8BGG7 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ubash3bQ8BGG7 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ubash3bQ8BGG7 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Ubash3bQ8BGG7 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Ubash3bQ8BGG7 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Ubash3bQ8BGG7 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Ubash3bQ8BGG7 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ubash3bQ8BGG7 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ubash3bQ8BGG7 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ubash3bQ8BGG7 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ubash3bQ8BGG7 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ubash3bQ8BGG7 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ubash3bQ8BGG7 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ubash3bQ8BGG7 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ubash3bQ8BGG7 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ubash3bQ8BGG7 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ubash3bQ8BGG7 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ubash3bQ8BGG7 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ubash3bQ8BGG7 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ubash3bQ8BGG7 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
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