Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW7

H2-M10.5, Histocompatibility 2, M region locus 10.5, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.5Q85ZW7 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
H2-M10.5Q85ZW7 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
H2-M10.5Q85ZW7 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
H2-M10.5Q85ZW7 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
H2-M10.5Q85ZW7 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
H2-M10.5Q85ZW7 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
H2-M10.5Q85ZW7 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
H2-M10.5Q85ZW7 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
H2-M10.5Q85ZW7 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
H2-M10.5Q85ZW7 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
H2-M10.5Q85ZW7 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
H2-M10.5Q85ZW7 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
H2-M10.5Q85ZW7 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
H2-M10.5Q85ZW7 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
H2-M10.5Q85ZW7 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
H2-M10.5Q85ZW7 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
H2-M10.5Q85ZW7 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
H2-M10.5Q85ZW7 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
H2-M10.5Q85ZW7 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
H2-M10.5Q85ZW7 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
H2-M10.5Q85ZW7 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
H2-M10.5Q85ZW7 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
H2-M10.5Q85ZW7 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
H2-M10.5Q85ZW7 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
H2-M10.5Q85ZW7 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
H2-M10.5Q85ZW7 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
H2-M10.5Q85ZW7 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
H2-M10.5Q85ZW7 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
H2-M10.5Q85ZW7 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
H2-M10.5Q85ZW7 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
H2-M10.5Q85ZW7 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
H2-M10.5Q85ZW7 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
H2-M10.5Q85ZW7 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
H2-M10.5Q85ZW7 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
H2-M10.5Q85ZW7 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
H2-M10.5Q85ZW7 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
H2-M10.5Q85ZW7 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
H2-M10.5Q85ZW7 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
H2-M10.5Q85ZW7 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
H2-M10.5Q85ZW7 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
H2-M10.5Q85ZW7 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
H2-M10.5Q85ZW7 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
H2-M10.5Q85ZW7 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
H2-M10.5Q85ZW7 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
H2-M10.5Q85ZW7 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
H2-M10.5Q85ZW7 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
H2-M10.5Q85ZW7 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
H2-M10.5Q85ZW7 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
H2-M10.5Q85ZW7 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
H2-M10.5Q85ZW7 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
H2-M10.5Q85ZW7 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
H2-M10.5Q85ZW7 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
H2-M10.5Q85ZW7 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
H2-M10.5Q85ZW7 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
H2-M10.5Q85ZW7 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
H2-M10.5Q85ZW7 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
H2-M10.5Q85ZW7 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
H2-M10.5Q85ZW7 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
H2-M10.5Q85ZW7 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
H2-M10.5Q85ZW7 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
H2-M10.5Q85ZW7 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
H2-M10.5Q85ZW7 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
H2-M10.5Q85ZW7 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
H2-M10.5Q85ZW7 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
H2-M10.5Q85ZW7 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
H2-M10.5Q85ZW7 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
H2-M10.5Q85ZW7 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
H2-M10.5Q85ZW7 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
H2-M10.5Q85ZW7 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
H2-M10.5Q85ZW7 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
H2-M10.5Q85ZW7 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
H2-M10.5Q85ZW7 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
H2-M10.5Q85ZW7 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
H2-M10.5Q85ZW7 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
H2-M10.5Q85ZW7 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
H2-M10.5Q85ZW7 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
H2-M10.5Q85ZW7 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
H2-M10.5Q85ZW7 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
H2-M10.5Q85ZW7 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
H2-M10.5Q85ZW7 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
H2-M10.5Q85ZW7 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
H2-M10.5Q85ZW7 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
H2-M10.5Q85ZW7 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
H2-M10.5Q85ZW7 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
H2-M10.5Q85ZW7 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
H2-M10.5Q85ZW7 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
H2-M10.5Q85ZW7 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
H2-M10.5Q85ZW7 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
H2-M10.5Q85ZW7 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
H2-M10.5Q85ZW7 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
H2-M10.5Q85ZW7 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
H2-M10.5Q85ZW7 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
H2-M10.5Q85ZW7 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
H2-M10.5Q85ZW7 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
H2-M10.5Q85ZW7 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
H2-M10.5Q85ZW7 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
H2-M10.5Q85ZW7 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
H2-M10.5Q85ZW7 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
H2-M10.5Q85ZW7 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
H2-M10.5Q85ZW7 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms