Protein–RNA interactions for Protein: Q810M6

Liat1, Protein LIAT1, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Liat1Q810M6 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Liat1Q810M6 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Liat1Q810M6 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Liat1Q810M6 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Liat1Q810M6 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Liat1Q810M6 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Liat1Q810M6 Ppp1r18-201ENSMUST00000113814 3131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Liat1Q810M6 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Liat1Q810M6 Mknk1-202ENSMUST00000106513 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Liat1Q810M6 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Liat1Q810M6 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Liat1Q810M6 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Liat1Q810M6 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Liat1Q810M6 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Liat1Q810M6 Hnrnph2-203ENSMUST00000074950 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Liat1Q810M6 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Liat1Q810M6 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Liat1Q810M6 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Liat1Q810M6 Aar2-202ENSMUST00000109570 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Liat1Q810M6 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Liat1Q810M6 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Liat1Q810M6 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Liat1Q810M6 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Liat1Q810M6 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Liat1Q810M6 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Liat1Q810M6 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Liat1Q810M6 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Liat1Q810M6 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Liat1Q810M6 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Liat1Q810M6 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Liat1Q810M6 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Liat1Q810M6 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Liat1Q810M6 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Liat1Q810M6 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Liat1Q810M6 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Liat1Q810M6 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Liat1Q810M6 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Liat1Q810M6 Pdha1-201ENSMUST00000033662 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Liat1Q810M6 Srsf6-203ENSMUST00000130411 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Liat1Q810M6 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Liat1Q810M6 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Liat1Q810M6 Plekhg4-203ENSMUST00000160191 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Liat1Q810M6 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Liat1Q810M6 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Liat1Q810M6 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Liat1Q810M6 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Liat1Q810M6 BC004004-201ENSMUST00000064709 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Liat1Q810M6 Mcam-202ENSMUST00000098852 2772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Liat1Q810M6 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Liat1Q810M6 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Liat1Q810M6 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Liat1Q810M6 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Liat1Q810M6 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Liat1Q810M6 Gm45449-201ENSMUST00000211485 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Liat1Q810M6 Mrrf-201ENSMUST00000028250 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Liat1Q810M6 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Liat1Q810M6 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Liat1Q810M6 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Liat1Q810M6 Pls3-201ENSMUST00000033547 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Liat1Q810M6 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Liat1Q810M6 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Liat1Q810M6 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Liat1Q810M6 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Liat1Q810M6 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Liat1Q810M6 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Liat1Q810M6 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Liat1Q810M6 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Liat1Q810M6 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Liat1Q810M6 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Liat1Q810M6 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Liat1Q810M6 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Liat1Q810M6 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Liat1Q810M6 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Liat1Q810M6 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Liat1Q810M6 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Liat1Q810M6 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Liat1Q810M6 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Liat1Q810M6 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Liat1Q810M6 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Liat1Q810M6 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Liat1Q810M6 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Liat1Q810M6 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Liat1Q810M6 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Liat1Q810M6 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Liat1Q810M6 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Liat1Q810M6 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Liat1Q810M6 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Liat1Q810M6 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Liat1Q810M6 Alox12-201ENSMUST00000000329 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Liat1Q810M6 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Liat1Q810M6 AC131586.1-201ENSMUST00000228844 2964 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Liat1Q810M6 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Liat1Q810M6 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Liat1Q810M6 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Liat1Q810M6 Prss57-203ENSMUST00000169684 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Liat1Q810M6 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Liat1Q810M6 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Liat1Q810M6 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Liat1Q810M6 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Liat1Q810M6 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms