Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZU4

Smim19, Small integral membrane protein 19, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim19Q80ZU4 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Smim19Q80ZU4 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Smim19Q80ZU4 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Smim19Q80ZU4 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Smim19Q80ZU4 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Smim19Q80ZU4 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Smim19Q80ZU4 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Smim19Q80ZU4 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Smim19Q80ZU4 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Smim19Q80ZU4 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Smim19Q80ZU4 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Smim19Q80ZU4 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Smim19Q80ZU4 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Smim19Q80ZU4 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Smim19Q80ZU4 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Smim19Q80ZU4 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Smim19Q80ZU4 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Smim19Q80ZU4 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Smim19Q80ZU4 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Smim19Q80ZU4 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Smim19Q80ZU4 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Smim19Q80ZU4 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Smim19Q80ZU4 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Smim19Q80ZU4 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Smim19Q80ZU4 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Smim19Q80ZU4 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Smim19Q80ZU4 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Smim19Q80ZU4 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Smim19Q80ZU4 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Smim19Q80ZU4 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Smim19Q80ZU4 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Smim19Q80ZU4 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Smim19Q80ZU4 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Smim19Q80ZU4 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Smim19Q80ZU4 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Smim19Q80ZU4 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Smim19Q80ZU4 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Smim19Q80ZU4 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Smim19Q80ZU4 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Smim19Q80ZU4 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Smim19Q80ZU4 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Smim19Q80ZU4 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Smim19Q80ZU4 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Smim19Q80ZU4 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Smim19Q80ZU4 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Smim19Q80ZU4 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Smim19Q80ZU4 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Smim19Q80ZU4 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Smim19Q80ZU4 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Smim19Q80ZU4 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Smim19Q80ZU4 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Smim19Q80ZU4 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Smim19Q80ZU4 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Smim19Q80ZU4 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Smim19Q80ZU4 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Smim19Q80ZU4 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Smim19Q80ZU4 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Smim19Q80ZU4 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Smim19Q80ZU4 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Smim19Q80ZU4 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Smim19Q80ZU4 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Smim19Q80ZU4 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Smim19Q80ZU4 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Smim19Q80ZU4 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Smim19Q80ZU4 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Smim19Q80ZU4 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Smim19Q80ZU4 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Smim19Q80ZU4 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Smim19Q80ZU4 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Smim19Q80ZU4 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Smim19Q80ZU4 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Smim19Q80ZU4 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Smim19Q80ZU4 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Smim19Q80ZU4 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Smim19Q80ZU4 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Smim19Q80ZU4 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Smim19Q80ZU4 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Smim19Q80ZU4 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Smim19Q80ZU4 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Smim19Q80ZU4 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Smim19Q80ZU4 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Smim19Q80ZU4 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Smim19Q80ZU4 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Smim19Q80ZU4 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Smim19Q80ZU4 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Smim19Q80ZU4 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Smim19Q80ZU4 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Smim19Q80ZU4 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Smim19Q80ZU4 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Smim19Q80ZU4 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Smim19Q80ZU4 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Smim19Q80ZU4 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Smim19Q80ZU4 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Smim19Q80ZU4 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Smim19Q80ZU4 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Smim19Q80ZU4 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Smim19Q80ZU4 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Smim19Q80ZU4 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Smim19Q80ZU4 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Smim19Q80ZU4 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms