Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSS2

Ube2q1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 Q1, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2q1Q7TSS2 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ube2q1Q7TSS2 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ube2q1Q7TSS2 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ube2q1Q7TSS2 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ube2q1Q7TSS2 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ube2q1Q7TSS2 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ube2q1Q7TSS2 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ube2q1Q7TSS2 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ube2q1Q7TSS2 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ube2q1Q7TSS2 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ube2q1Q7TSS2 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ube2q1Q7TSS2 Ccdc60-202ENSMUST00000086483 2168 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ube2q1Q7TSS2 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ube2q1Q7TSS2 Gm15725-201ENSMUST00000119947 1090 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ube2q1Q7TSS2 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ube2q1Q7TSS2 Gm13605-201ENSMUST00000124489 658 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ube2q1Q7TSS2 Treml4-202ENSMUST00000125426 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ube2q1Q7TSS2 2610005L07Rik-201ENSMUST00000139264 948 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ube2q1Q7TSS2 Gm6485-201ENSMUST00000160676 439 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ube2q1Q7TSS2 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ube2q1Q7TSS2 Gm21092-201ENSMUST00000178995 955 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ube2q1Q7TSS2 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ube2q1Q7TSS2 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ube2q1Q7TSS2 1700012D14Rik-204ENSMUST00000210788 547 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ube2q1Q7TSS2 Gm11149-203ENSMUST00000215465 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ube2q1Q7TSS2 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ube2q1Q7TSS2 Gm3285-201ENSMUST00000218443 908 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ube2q1Q7TSS2 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ube2q1Q7TSS2 AC155712.2-201ENSMUST00000220398 643 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ube2q1Q7TSS2 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ube2q1Q7TSS2 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ube2q1Q7TSS2 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ube2q1Q7TSS2 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ube2q1Q7TSS2 Mir483-201ENSMUST00000093631 73 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ube2q1Q7TSS2 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ube2q1Q7TSS2 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ube2q1Q7TSS2 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ube2q1Q7TSS2 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ube2q1Q7TSS2 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ube2q1Q7TSS2 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ube2q1Q7TSS2 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ube2q1Q7TSS2 Gm7278-201ENSMUST00000119836 1401 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ube2q1Q7TSS2 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ube2q1Q7TSS2 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ube2q1Q7TSS2 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ube2q1Q7TSS2 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ube2q1Q7TSS2 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ube2q1Q7TSS2 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ube2q1Q7TSS2 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ube2q1Q7TSS2 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ube2q1Q7TSS2 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ube2q1Q7TSS2 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ube2q1Q7TSS2 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ube2q1Q7TSS2 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ube2q1Q7TSS2 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ube2q1Q7TSS2 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ube2q1Q7TSS2 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ube2q1Q7TSS2 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ube2q1Q7TSS2 Akr1b10-202ENSMUST00000115051 1022 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ube2q1Q7TSS2 Gm22711-201ENSMUST00000116890 133 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ube2q1Q7TSS2 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ube2q1Q7TSS2 Gm16166-201ENSMUST00000118291 787 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ube2q1Q7TSS2 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ube2q1Q7TSS2 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ube2q1Q7TSS2 1700025F24Rik-201ENSMUST00000185238 894 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ube2q1Q7TSS2 Rpain-201ENSMUST00000018593 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ube2q1Q7TSS2 Gm29083-201ENSMUST00000189205 733 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ube2q1Q7TSS2 Bcap31-201ENSMUST00000002091 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ube2q1Q7TSS2 Gm40578-201ENSMUST00000220837 390 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ube2q1Q7TSS2 Gm6685-201ENSMUST00000042595 764 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ube2q1Q7TSS2 Olfr284-201ENSMUST00000063289 918 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ube2q1Q7TSS2 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ube2q1Q7TSS2 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ube2q1Q7TSS2 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ube2q1Q7TSS2 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ube2q1Q7TSS2 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ube2q1Q7TSS2 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ube2q1Q7TSS2 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ube2q1Q7TSS2 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ube2q1Q7TSS2 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ube2q1Q7TSS2 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ube2q1Q7TSS2 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ube2q1Q7TSS2 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ube2q1Q7TSS2 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ube2q1Q7TSS2 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ube2q1Q7TSS2 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ube2q1Q7TSS2 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ube2q1Q7TSS2 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ube2q1Q7TSS2 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ube2q1Q7TSS2 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ube2q1Q7TSS2 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ube2q1Q7TSS2 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ube2q1Q7TSS2 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ube2q1Q7TSS2 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ube2q1Q7TSS2 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ube2q1Q7TSS2 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ube2q1Q7TSS2 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ube2q1Q7TSS2 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ube2q1Q7TSS2 n-R5s64-201ENSMUST00000102019 119 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ube2q1Q7TSS2 Gm22920-201ENSMUST00000102175 109 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms