Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPR4

Actn1, Alpha-actinin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 892 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn1Q7TPR4 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Actn1Q7TPR4 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Actn1Q7TPR4 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Actn1Q7TPR4 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Actn1Q7TPR4 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Actn1Q7TPR4 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Actn1Q7TPR4 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Actn1Q7TPR4 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Actn1Q7TPR4 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Actn1Q7TPR4 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Actn1Q7TPR4 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Actn1Q7TPR4 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Actn1Q7TPR4 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Actn1Q7TPR4 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Actn1Q7TPR4 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Actn1Q7TPR4 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Actn1Q7TPR4 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Actn1Q7TPR4 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Actn1Q7TPR4 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Actn1Q7TPR4 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Actn1Q7TPR4 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Actn1Q7TPR4 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Actn1Q7TPR4 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Actn1Q7TPR4 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Actn1Q7TPR4 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Actn1Q7TPR4 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Actn1Q7TPR4 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Actn1Q7TPR4 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Actn1Q7TPR4 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Actn1Q7TPR4 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Actn1Q7TPR4 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Actn1Q7TPR4 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Actn1Q7TPR4 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Actn1Q7TPR4 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Actn1Q7TPR4 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Actn1Q7TPR4 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Actn1Q7TPR4 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Actn1Q7TPR4 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Actn1Q7TPR4 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Actn1Q7TPR4 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Actn1Q7TPR4 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Actn1Q7TPR4 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Actn1Q7TPR4 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Actn1Q7TPR4 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Actn1Q7TPR4 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Actn1Q7TPR4 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Actn1Q7TPR4 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Actn1Q7TPR4 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Actn1Q7TPR4 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Actn1Q7TPR4 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Actn1Q7TPR4 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Actn1Q7TPR4 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Actn1Q7TPR4 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Actn1Q7TPR4 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Actn1Q7TPR4 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Actn1Q7TPR4 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Actn1Q7TPR4 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Actn1Q7TPR4 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Actn1Q7TPR4 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Actn1Q7TPR4 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Actn1Q7TPR4 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Actn1Q7TPR4 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Actn1Q7TPR4 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Actn1Q7TPR4 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Actn1Q7TPR4 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Actn1Q7TPR4 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Actn1Q7TPR4 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Actn1Q7TPR4 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Actn1Q7TPR4 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Actn1Q7TPR4 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Actn1Q7TPR4 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Actn1Q7TPR4 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Actn1Q7TPR4 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Actn1Q7TPR4 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Actn1Q7TPR4 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Actn1Q7TPR4 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Actn1Q7TPR4 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Actn1Q7TPR4 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Actn1Q7TPR4 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Actn1Q7TPR4 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Actn1Q7TPR4 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Actn1Q7TPR4 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Actn1Q7TPR4 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Actn1Q7TPR4 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Actn1Q7TPR4 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Actn1Q7TPR4 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Actn1Q7TPR4 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Actn1Q7TPR4 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Actn1Q7TPR4 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Actn1Q7TPR4 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Actn1Q7TPR4 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Actn1Q7TPR4 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Actn1Q7TPR4 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Actn1Q7TPR4 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Actn1Q7TPR4 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Actn1Q7TPR4 Gm29787-201ENSMUST00000222129 849 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Actn1Q7TPR4 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Actn1Q7TPR4 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Actn1Q7TPR4 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Actn1Q7TPR4 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms